A western Sahara centre of domestication inferred from pearl millet genomes | Un centre de domestication au Sahara occidental pour le millet perlé déduit des génomes
2018
Burgarella, Concetta | Cubry, Philippe | Kane, Ndjido, A | Varshney, Rajeev, K | Mariac, Cedric | Liu, Xin | Shi, Chengcheng | Thudi, Mahendar | Couderc, Marie | Xu, Xun | Chitikineni, Annapurna | Scarcelli, Nora | Barnaud, Adeline | Rhoné, Bénédicte | Dupuy, Christian | François, Olivier | Berthouly-Salazar, Cécile | Vigouroux, Yves | Diversité, adaptation, développement des plantes (UMR DIADE) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie])-Université de Montpellier (UM) | Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro) | LMI Adaptation des Plantes et microorganismes associés aux Stress Environnementaux [Dakar] (LAPSE) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD) | International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics [Inde] (ICRISAT) ; Consultative Group on International Agricultural Research [CGIAR] (CGIAR) | Beijing Genomics Institute [Shenzhen] (BGI) | Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE) ; Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Institut des Mondes Africains (IMAF) ; Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Modèles et Algorithmes pour la Génomique (TIMC-MAGe) ; Translational Innovation in Medicine and Complexity / Recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité - UMR 5525 (TIMC) ; VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP) ; Université Grenoble Alpes (UGA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP) ; Université Grenoble Alpes (UGA) | Agence Nationale de la Recherche : ANR-13-BSV7-0017 ; Agropolis Fondation under the Investissements d'avenir programme : 1403-057 ; ANR-10-LABX-0001-01 | ANR-13-BSV7-0017,AfriCrop,Etude de l'histoire évolutive des plantes domestiquées africaines(2013)
International audience
Mostrar más [+] Menos [-]Inglés. There have been intense debates over the geographic origin of African crops and agriculture. Here, we used whole-genome sequencing data to infer the domestication origin of pearl millet (Cenchrus americanus, syn. Pennisetum glaucum). Our results supported an origin in western Sahara, and we dated the onset of cultivated pearl millet expansion in Africa to 4.900 years ago. We provided evidence that wild-to-crop gene flow increased cultivated genetic diversity leading to diversity hotspots in western and eastern Sahel and adaptive introgression of 15 genomic regions. Our study reconciled genetic and archaeological data for one of the oldest African crops.
Mostrar más [+] Menos [-]Francés. L'origine géographique de la culture et de l'agriculture des céréales africaines a fait l'objet d'intenses débats. Nous utilisons ici les données du séquençage complet du génome du millet perlé (Cenchrus americanus, syn. Pennisetum glaucum) pour en déduire l'origine de sa domestication. Nos résultats confirment que ce foyer se situe au Sahara occidental, et nous datons le début de l'expansion de la culture de cette graminée à 4.900 ans. Nous démontrons qu’une augmentation du flux de gènes des variétés sauvages est à l’origine de la diversité génétique de la plante cultivée, lequel phénomène a conduit à des points chauds de diversité dans l'ouest et l'est du Sahel et à l'introgression adaptative de 15 régions génomiques. Les données génétiques et archéologiques s’accordent et permettent de retracer l’histoire ancienne de l’exploitation alimentaire de cette céréale africaine.
Mostrar más [+] Menos [-]Palabras clave de AGROVOC
Información bibliográfica
Este registro bibliográfico ha sido proporcionado por Institut national de la recherche agronomique