Database of queryable gene expression patterns for Xenopus.
2009
Gilchrist, Michael J | Christensen, Mikkel B | Bronchain, Odile | Brunet, Frédéric | Chesneau, Albert | Fenger, Ursula | Geach, Timothy J | Ironfield, Holly V | Kaya, Ferdinand | Kricha, Sadia | Lea, Robert | Massé, Karine | Néant, Isabelle | Paillard, Elodie | Parain, Karine | Perron, Muriel | Sinzelle, Ludivine | Souopgui, Jacob | Thuret, Raphaël | Ymlahi-Ouazzani, Qods | Pollet, Nicolas | Wellcome Trust/Cancer Research UK Gurdon Institute ; University of Cambridge [UK] (CAM) | Programme d'Épigénomique ; Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Neurobiologie et Développement (N&eD) ; Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Institut de Neurobiologie Alfred Fessard (INAF) ; Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL) ; École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon) ; Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Développement et évolution (DE) ; Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] (DKFZ) | National Institute for Medical Research (NIMR) ; Medical Research Council | Institut de Biologie et de Médecine Moléculaires [Gosselies] (ULB/IBMM) ; Faculté des Sciences [Bruxelles] (ULB) ; Université libre de Bruxelles (ULB)-Université libre de Bruxelles (ULB)-Faculté de Médecine [Bruxelles] (ULB) ; Université libre de Bruxelles (ULB) | University of Manchester [Manchester] | Composantes innées de la réponse immunitaire et différenciation (CIRID) ; Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Centre de biologie du développement (CBD) ; Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI) ; Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
International audience
Mostrar más [+] Menos [-]Inglés. The precise localization of gene expression within the developing embryo, and how it changes over time, is one of the most important sources of information for elucidating gene function. As a searchable resource, this information has up until now been largely inaccessible to the Xenopus community. Here, we present a new database of Xenopus gene expression patterns, queryable by specific location or region in the embryo. Pattern matching can be driven either from an existing in situ image, or from a user-defined pattern based on development stage schematic diagrams. The data are derived from the work of a group of 21 Xenopus researchers over a period of 4 days. We used a novel, rapid manual annotation tool, XenMARK, which exploits the ability of the human brain to make the necessary distortions in transferring data from the in situ images to the standard schematic geometry. Developmental Dynamics 238:1379-1388, 2009. (c) 2009 Wiley-Liss, Inc.
Mostrar más [+] Menos [-]Palabras clave de AGROVOC
Información bibliográfica
Este registro bibliográfico ha sido proporcionado por Institut national de la recherche agronomique