Two disjunct Pleistocene populations and anisotropic postglacial expansion shaped the current genetic structure of the relict plant Amborella trichopoda
2017
Tournebize, Rémi | Manel, Stéphanie | Vigouroux, Yves | Munoz, François | de Kochko, Alexandre | Poncet, Valérie | Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE) ; Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro) | Diversité, adaptation, développement des plantes (UMR DIADE) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie]) | Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie]) | Institut Français de Pondichéry (IFP) ; Ministère de l'Europe et des Affaires étrangères (MEAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Diversité et adaptation des plantes cultivées (UMR DIAPC) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)
International audience
Mostrar más [+] Menos [-]Inglés. Past climate fluctuations shaped the population dynamics of organisms in space and time, and have impacted their present intra-specific genetic structure. Demo-genetic modelling allows inferring the way past demographic and migration dynamics have determined this structure. Amborella trichopoda is an emblematic relict plant endemic to New Caledonia, widely distributed in the understory of non-ultramafic rainforests. We assessed the influence of the last glacial climates on the demographic history and the paleo-distribution of 12 Amborella populations covering the whole current distribution. We performed coalescent genetic modelling of these dynamics, based on both whole-genome resequencing and microsatellite genotyping data. We found that the two main genetic groups of Amborella were shaped by the divergence of two ancestral populations during the last glacial maximum. From 12,800 years BP, the South ancestral population has expanded 6.3-fold while the size of the North population has remained stable. Recent asymmetric gene flow between the groups further contributed to the phylogeographical pattern. Spatially explicit coalescent modelling allowed us to estimate the location of ancestral populations with good accuracy (< 22 km) and provided indications regarding the mid-elevation pathways that facilitated post-glacial expansion.
Mostrar más [+] Menos [-]Palabras clave de AGROVOC
Información bibliográfica
Este registro bibliográfico ha sido proporcionado por Institut national de la recherche agronomique