A Genome Wide Association Study on plasma FV levels identified PLXDC2 as a new modifier of the coagulation process
2019
Thibord, Florian | Hardy, Lise | Ibrahim-Kosta, Manal | Saut, Noémie | Pulcrano‐nicolas, Anne‐sophie | Goumidi, Louisa | Civelek, Mete | Eriksson, Per | Deleuze, Jean‐françois | Le Goff, Wilfried | Trégouët, David‐alexandre | Morange, Pierre | Sorbonne Université (SU) | Université de Bordeaux (UB) | Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases (ICAN) ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut de Cardiométabolisme et Nutrition = Institute of Cardiometabolism and Nutrition [CHU Pitié Salpêtrière] (IHU ICAN) ; CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU) | Bordeaux population health (BPH) ; Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) | Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE) | Aix Marseille Université (AMU) | Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research (C2VN) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) | University of Virginia | Karolinska Institutet [Stockholm] | University Hospital | Centre National de Génotypage (CNG) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | Fondation Jean Dausset | Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH) ; Institut de Biologie François JACOB (JACOB) ; Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM) | ANR-10-LABX-0013 | ANR-10-LABX-0013,GENMED,Medical Genomics(2010)
International audience
Mostrar más [+] Menos [-]Inglés. Background Factor V (FV) is a circulating protein primarily synthesized in the liver, and mainly present in plasma. It is a major component of the coagulation process. Objective To detect novel genetic loci participating to the regulation of FV plasma levels. Methods We conducted the first Genome Wide Association Study on FV plasma levels in a sample of 510 individuals and replicated the main findings in an independent sample of 1156 individuals. Results In addition to genetic variations at the F5 locus, we identified novel associations at the PLXDC2 locus, with the lead PLXDC2 rs927826 polymorphism explaining ~3.7% (P = 7.5 × 10−15 in the combined discovery and replication samples) of the variability of FV plasma levels. In silico transcriptomic analyses in various cell types confirmed that PLXDC2 expression is positively correlated to F5 expression. SiRNA experiments in human hepatocellular carcinoma cell line confirmed the role of PLXDC2 in modulating factor F5 gene expression, and revealed further influences on F2 and F10 expressions. Conclusion Our study identified PLXDC2 as a new molecular player of the coagulation process.
Mostrar más [+] Menos [-]Palabras clave de AGROVOC
Información bibliográfica
Este registro bibliográfico ha sido proporcionado por Institut national de la recherche agronomique