A new typing technique for the Rickettsiales Ehrlichia ruminantium: Multiple-locus variable number tandem repeat analysis
2012
Pilet, Héloïse | Vachiery, Nathalie | Berrich, Moez | Bouchouicha, Rim | Durand, Benoit | Pruneau, Ludovic | Pinarello, Valérie | Saldana, Angélique | Carasco-Lacombe, Catherine | Lefrancois, Thierry | Meyer, Damien | Martinez, Dominique | Boulouis, Henri-Jean | Haddad, Nadia | Biologie moléculaire et immunologie parasitaires et fongiques (BIPAR) ; École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Normandie ; Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12) | Contrôle des maladies animales exotiques et émergentes (UMR CMAEE) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) | Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad) | Virologie UMR1161 (VIRO) ; École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES) | Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB) ; Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA) | Neuromimetic intelligence (CORTEX) ; INRIA Lorraine ; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (LORIA) ; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Université Nancy 2-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Université Nancy 2-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | CRVOI [PRAO/AlqD/CRVOI/08/05]; European project, FEDER [FED 1/1.4-30305]; [GIP INRA-CIRAD]
International audience
Mostrar más [+] Menos [-]Inglés. Ehrlichia ruminantium (ER) is a member of the order Rickettsiales transmitted by Amblyomma ticks. This obligatory intracellular bacterium is the causative agent of a fatal disease in ruminants, named heartwater. It represents a constraint on breeding development in sub-Saharan Africa and in the Caribbean. The genetic diversity of the strains of ER, which could be a limiting factor to obtain effective vaccines, needs to be better characterized. For this purpose, we developed a molecular typing technique based on the polymorphism of variable number tandem repeat (VNTR) sequences, MLVA (multiple locus VNTR analysis).Eight (out of 21) VNTR candidates were validated using 17 samples representing a panel of ER strains from different geographical origins from West, South Africa, and Caribbean areas and in ER infected ticks and goat tissues. This result demonstrated the ability of these VNTRs to type a wide range of strains. The stability of the selected VNTR markers was very good, at the time scale needed for epidemiological purposes: in particular, no difference in the VNTR profiles was observed between virulent and attenuated strains (for Gardel and Senegal strains) and between strains (Gardel and Blonde strains) isolated in the same area 19 years apart. We validated the strong discriminatory power of MLVA for ER and found a high level of polymorphism between the available strains, with 10 different profiles out of 13 ER strains.The MLVA scheme described in this study is a rapid and efficient molecular typing tool for ER, which allows rapid and direct typing of this intracellular pathogen without preliminary culture and gives reliable results that can be used for further epidemiological studies. (C) 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.
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Información bibliográfica
Este registro bibliográfico ha sido proporcionado por Institut national de la recherche agronomique