The genetic history of Mayotte and Madagascar cattle breeds mirrors the complex pattern of human exchanges in Western Indian Ocean
2022
Magnier, Jessica | Druet, Tom | Naves, Michel | Ouvrard, Mélissa | Raoul, Solène | Janelle, Jérôme | Moazami-Goudarzi, Katayoun | Lesnoff, Matthieu | Tillard, Emmanuel | Gautier, Mathieu | Flori, Laurence | Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux (UMR SELMET) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | Département Environnements et Sociétés (Cirad-ES) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad) | Université de Liège = University of Liège = Universiteit van Luik = Universität Lüttich (ULiège) | Agroécologie, génétique et systèmes d’élevage tropicaux (ASSET) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | CoopADEM | Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI) ; AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM)
International audience
Mostrar más [+] Menos [-]Inglés. Despite their central economic and cultural role, the origin of cattle populations living in Indian Ocean islands still remains poorly documented. Here, we unravel the demographic and adaptive histories of the extant Zebus from the Mayotte and Madagascar islands using high-density SNP genotyping data. We found that these populations are very closely related and both display a predominant indicine ancestry. They diverged in the 16th century at the arrival of European people who transformed the trade network in the area. Their common ancestral cattle population originates from an admixture between an admixed African zebu population and an Indian zebu that occurred around the 12th century at the time of the earliest contacts between human African populations of the Swahili corridor and Austronesian people from Southeast Asia in Comoros and Madagascar. A steep increase in the estimated population sizes from the beginning of the 16th to the 17th century coincides with the expansion of the cattle trade. By carrying out genome scans for recent selection in the two cattle populations from Mayotte and Madagascar, we identified sets of candidate genes involved in biological functions (cancer, skin structure, and UV-protection, nervous system and behavior, organ development, metabolism, and immune response) broadly representative of the physiological adaptation to tropical conditions. Overall, the origin of the cattle populations from Western Indian Ocean islands mirrors the complex history of human migrations and trade in this area.
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Información bibliográfica
Este registro bibliográfico ha sido proporcionado por Institut national de la recherche agronomique