Large variability of soil microbial diversity and functions in an over 20-year old Eucalyptus grandis plantation
2025
Brondani, Margot | Robin, Agnès | Marchal, Julie | Pablo, Anne-Laure | Personne, Aline | Desmarais, Erick | Cerqueira, Frédérique | Mahé, Frédéric | Degrune, Florine | Guillemot, Joannès | Brancalion, Pedro H.S. | Fromin, Nathalie | Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" (ESALQ) ; Universidade de São Paulo = University of São Paulo (USP) | Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM) | Plant Health Institute of Montpellier (UMR PHIM) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM) | Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE) ; École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM)-Université de Montpellier Paul-Valéry (UMPV) | ANR-10-LABX-0004,CeMEB,Mediterranean Center for Environment and Biodiversity(2010) | ANR-16-IDEX-0006,MUSE,MUSE(2016) | ANR-11-INBS-0013,IFB (ex Renabi-IFB),Institut français de bioinformatique(2011)
International audience
Mostrar más [+] Menos [-]Inglés. The spatial heterogeneity in soil properties as well as in molecular and catabolic diversities of the soil microbial community were investigated by soil analyses, Illumina MiSeq sequencing and MicroResp™ profiling, respectively, in 51 plots of a 20 year-old eucalyptus plantation in south Brazil. The relationships between these parameters were assessed to test whether small scale variation in soil properties and understory vegetation generated heterogeneity in the soil microbial community. The spatial variability of soil microbial community and functioning was shown to be substantial. A greenness index, used as a proxy of the density of the understory biomass, explained very little of the soil microbial parameters. Variability in soil properties (mainly C availability, pH) partly explained shifts in molecular and catabolic parameters of the soil microbial community. Bacterial (and, to a lower extent, fungal) molecular parameters were the main factors explaining the catabolic capabilities of the soil microbial community. But overall, the sequencing data was of little use in explaining C processes in these soils, underlying the difficulty in predicting the contribution of large tree-plantations to the global C cycle.
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Este registro bibliográfico ha sido proporcionado por Institut national de la recherche agronomique