Genetic diversity of creole chickens in Valles Centrales, Oaxaca, using microsatellite markers | Diversidad genética de gallinas criollas en valles centrales de Oaxaca usando marcadores microsatélites

Inglés. The population of creole chickens in small-scale farms is remarkably diverse and part of the poultry genetic reservoir in Mexico. Furthermore, this population represents a vital protein source for rural families. The genetic variability of creole chicken populations in the central region of Oaxaca was determined in blood samples collected from 109 creole chickens belonging to 17 populations and 30 Plymouth Rock chickens (control group). Ten microsatellite markers were used to detect a total of 109 alleles, with an average of 10.9 ± 3.1 alleles per locus. The observed heterozygosity (Ho) ranged from 0.575 (San Lucas) to 0.750 (San Antonio 2); the expected heterozygosity ranged from 0.625 (Control) to 0.733 (Huixtepec 2). Overall, it was observed an increase in the number of heterozygotes, evidenced by a global-level inbreeding (FIT) of 0.042; the FST population differentiation index was moderate (0.059),  and the inbreeding of individuals within populations (FIS) was negative (-0.017), which indicates an excess of heterozygotes at that level. Cluster analysis grouped the Nazareno, ITVO, San Lucas, and San Antonio populations, indicating that these creole chicken populations are isolated and genetically differentiated in some characteristics. This information is important to design future conservation, selection, and multiplication programs for this species at the backyard level in the central region of Oaxaca, Mexico.

Español; castellano. Las poblaciones de gallinas criollas en explotaciones en pequeña escala poseen una gran diversidad y son parte del reservorio genético avícola en México; además, constituyen una importante fuente de proteína para las familias del medio rural. Con el propósito de conocer la variabilidad genética de poblaciones de gallinas criollas en la región central de Oaxaca, se tomaron muestras de sangre de 109 gallinas criollas, provenientes de 17 poblaciones y de 30 gallinas Plymouth Rock como testigos. Se usaron 10 marcadores de tipo microsatélites, con los que se detectó un total de 109 alelos, con 10.9 ± 3.1 alelos por locus en promedio. La heterocigosidad observada (Ho) varió de 0.575 (San Lucas) a 0.750 (San Antonino 2) y la esperada (He) de 0.625 (Testigo) a 0.733 (Huixtepec 2). A nivel general se encontró un incremento en el número de heterocigotos evidenciado por un nivel de endogamia global (FIT) de 0.042; el índice FST de diferenciación entre poblaciones fue moderado (0.059) y la endogamia de individuos dentro de poblaciones (FIS) resultó negativa (-0.017), lo que indica un exceso de heterocigotos a ese nivel. El análisis de conglomerados agrupó a las poblaciones de Nazareno, ITVO, San Lucas y San Antonio, evidenciando que son poblaciones de gallinas criollas aisladas y diferenciadas genéticamente en algunas características. Esta información es importante para diseñar futuros programas de conservación, selección y multiplicación de esta especie a nivel de traspatio en la región central de Oaxaca, México.