GENETIC CHARACTERIZATION OF SOUTH AMERICA DOMESTIC GUINEA PIG USING MOLECULAR MARKERS | CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DEL CUY DOMÉSTICO EN AMÉRICA DEL SUR USANDO MARCADORES MOLECULARES

Inglés. Twenty specific primers were used to define the genetic diversity and structure of the domestic guinea pig (Cavia porcellus). The samples were collected from the Andean countries (Colombia, Ecuador, Peru and Bolivia). In addition, samples from Spain were used as an out-group for topological trees. The microsatellite markers were used and showed a high polymorphic content (PIC) 0.750, and heterozygosity values indicated microsatellites are highly informative. The genetic variability in populations of guinea pigs from Andean countries was (He: 0.791; Ho: 0.710), the average number of alleles was high (8.67). A deficit of heterozygotes (FIS: 0.153; p<0.05) was detected. Through the analysis of molecular variance (AMOVA) no significant differences were found among the guinea pigs of the Andean countries (FST: 2.9%); however a genetic differentiation of 16.67% between South American populations and the population from Spain was detected. A poor genetic structure was found among the Andean countries with high genetic variability. The results suggest that it is necessary to take urgent measures to prevent further genetic erosion of native guinea pigs in the Andean countries with plans for recovery and conservation of this important genetic resource in South America.

Español; castellano. Se utilizaron 20 cebadores específicos para definir la diversidad genética y la estructura del cobayo doméstico (Cavia porcellus). Las muestras fueron recolectadas de los países andinos (Colombia, Ecuador, Perú y Bolivia). Además, se utilizaron muestras de España como grupo externo de los árboles filogenéticos. Los marcadores microsatélites mostraron un alto contenido de información polimórfica (PIC) 0.750, y los valores de heterocigosidad indicaron que los microsatélites son altamente informativos. La variabilidad genética en las poblaciones de cuyes de los países andinos fue (He: 0.791, Ho: 0.710), el número promedio de alelos fue alto (8.67). Se detectó un déficit de heterozigotos (FIS: 0.153; p <0.05). A través del análisis de varianza molecular (AMOVA) no se encontraron diferencias significativas entre los cuyes de los países andinos (FST: 2.9%); Sin embargo, se detectó una diferenciación genética del 16,67% entre las poblaciones sudamericanas y la población española. Se encontró una estructura genética deficiente entre los países andinos con alta variabilidad genética. Los resultados sugieren que es necesario tomar medidas urgentes para prevenir una mayor erosión genética de cuyes nativos en los países andinos con planes para la recuperación y conservación de este importante recurso genético en América del Sur.