Évaluation de la biodiversité faunistique à partir des pelotes de réjection de la Chouette effraie Tyto alba dans les palmeraies de la région d’Ouargla (Sahara septentrional algérien) par la méthode classique et l’utilisation de l'ADN environnemental (ADNe)

كلية علوم الطبيعة والحياة Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie قسم العلوم الفلاحية Département des Sciences Agronomiques

Le présent travail a porté sur l’évaluation de biodiversité de la faune des palmeraies à travers l’analyse du régime alimentaire de la Chouette effraie Tyto alba de la région d’Ouargla (Sud-est algérien). Cette étude s’est appuyée sur l’analyse des pelotes de réjection ainsi que sur l’examen des restes dans les nids du rapace. L’analyse classique de 314 pelotes dans les trois stations (Mekhadma, Rouissat, et Hassi Ben Abdallah) a permis de recenser 631 items de proies représentant 4 classes, 8 ordres, 15 familles et 28 espèces. Les oiseaux représentent plus de la moitié du régime (AR : abondance relative = 63,2 %), en particulier les tourterelles Streptopelia sp. (AR = 32,7 %), suivies par les moineaux Passer sp. (AR = 25,4 %). Les rongeurs constituent le second groupe le plus abondant (AR = 32,33 %), caractérisés essentiellement par la souris grise Mus musculus (AR = 8,2 %). En termes de diversité, selon l’indice de Shannon est (H’= 3,15 Bit), entre temps, Tyto alba est considérée comme un prédateur généraliste par un régime diversifié (E : indice d’équitabilité = 0,6). L’analyse classique des fragments d’os est couplée avec une approche dite « metabarcoding environnemental », utilisée pour cibler spécifiquement les mammifères et les insectes. L’analyse classique de 234 pelotes issues des deux stations (Mekhadma et Rouissat) a permis de recenser 456 items de proies représentant 4 classes, 8 ordres, 15 familles et 26 espèces. Les rongeurs (9,4% ≤ AR ≤ 20,9 %), sont représentés essentiellement par Mus musculus (3,8 % ≤ AR ≤ 10,6 %). Quant aux insectes, ce sont les moins consommées (0,9% ≤ AR ≤ 1,7%), c’est le cas de Gryllotalpa sp. (0,85%) et Brachytrupes megacephalus (0,28%). L’analyse ADN, quant à elle, a révélé la présence de 7 espèces de proies (1 espèce de mammifère et 6 espèces d’insectes), d’autant plus que 5 espèces identifiées dont la répartition de quelques unes n’était pas encore confirmée par la l’analyse classique telles (Pimelia sp., Lilioceris sp., Carpophilus sp., Attagenus pellio, et Calliphora vicina). Cette nouvelle approche se révèle être un bon complément à la méthode classique, nous avons pu déterminer la présence de Brachytrupes megacephalus et Mus musculus avec les deux méthodes selon les spécificités de chacune. De ce fait, l’analyse ADN se pose comme une technique prometteuse pour reconstituer les régimes alimentaires des oiseaux de proies.

The present work has focused on the assessment of biodiversity of the fauna of palm groves through the analysis of the diet of the Tyto alba fright owl of the region of Ouargla (South-East of Algeria). This study was based on the analysis of regurditated pellet as well as on the examination of remains in raptor nests. The classical analysis of 314 pellets at the three stations (Mekhadma, Rouissat, and Hassi Ben Abdallah) identified 631 items of prey representing 4 classes, 8 orders, 15 families and 28 species. Birds account for more than half of the diet (RA: relative abundance = 63.2%), especially the turtle doves Streptopelia sp. (RA = 32.7%), followed by sparrows Passer sp. (RA = 25.4%). Rodents are the second most abundant group (RA = 32.33%), characterized essentially by the gray mouse Mus musculus (RA = 8.2%). In terms of diversity, according to the Shannon index is (H '= 3.15 Bit), meanwhile, Tyto alba is considered a generalist predator by a diversified diet (E: index of equitability = 0.6). The classical analysis of bone fragments is coupled with an approach called " metabarcoding environmental ", used to specifically target mammals and insects. The standard analysis of 234 pellets from the two stations (Mekhadma and Rouissat) identified 456 items of prey representing 4 classes, 8 orders, 15 families and 26 species. Rodents (9.4% ≤ RA ≤ 20.9%) are mainly represented by Mus musculus (3.8% ≤ RA ≤ 10.6%). As for insects, they are the least consumed (0.9% ≤ RA ≤ 1.7%), this is the case of Gryllotalpa sp. (0.85%) and Brachytrupes megacephalus (0.28%). The DNA analysis, meanwhile, revealed the presence of 7 species of prey (1 mammal species and 6 insect species), especially since 5 identified species whose distribution of some was not yet confirmed by the classical analysis such (Pimelia sp., Lilioceris sp., Carpophilus sp., Attagenus pellio, and Calliphora vicina). This new approach proves to be a good complement to the classical method, we have been able to determine the presence of Brachytrupes megacephalus and Mus musculus with both methods according to the specificities of each. As a result, DNA analysis is emerging as a promising technique for restoring the diets of prey birds.

ركز العمل الحالي على تقييم التنوع البيولوجي لحيوانات بساتين النخيل من خلال تحليل النظام الغذائي لبومة Tyto alba في منطقة ورقلة (جنوب شرق الجزائر). استندت هذه الدراسة إلى تحليل كريات الجوارح وكذلك على فحص البقايا في الأعشاش. حدد التحليل الكلاسيكي لـ 314 كرة في المحطات الثلاث (المخادمة والرويسات وحاسي بن عبد الله) وجود 631 قطعة من الفرائس تمثل 4 فصول و 8 أوامر و 15 عائلة و 28 نوعًا. تمثل الطيور أكثر من نصف في النظام الغذائي (الوفرة النسبية = 63.2 ٪) ، وخاصة الحمام ٪ 32.7 =Streptopelia sp. ، تليها العصافير Passer sp25.4 ٪. القوارض هي المجموعة الثانية الأكثر وفرة 32.33٪ ، وتتميز أساسا عن طريق الماوس الرمادي Mus Musculus 8.2 ٪. من حيث التنوع ، وفقًا لمؤشر شانون هوH '= 3.15Bit بت ، وفي الوقت نفسه ، يعتبر Tyto alba مفترسًا عامًا في نظام غذائي متنوع مؤشر المساواة E = 0.6. يقترن التحليل الكلاسيكي لشظايا العظام مع نهج يسمى "metabarcoding البيئية"، والذي سمح بتحديد عدة أنواع من عينة معقدة تحتوي على الحمض النووي من فريسة من أصول مختلفة. لقد استخدمناه لاستهداف الثدييات والحشرات على وجه التحديد. حدد التحليل المعياري ل 234 كرة من المحطتين (المخادمة ورويسات) 456 قطعة من الفرائس تمثل 4 فصول و 8 أوامر و 15 عائلة و 26 نوعًا. تمثل الطيور القيم بين (72.9≤ % AR: الوفرة النسبية ≤ 89.6 ٪) ، ولا سيما Streptopelia sp. ٪≤ AR ≤ 48.1 ٪ 37.1 ، تليها Passer sp. 29.1٪ ≤ AR ≤ ٪33.02 فيما يلي القوارض٪99.4% ≤ AR ≤ 20.، والتي تمثلها بشكل أساسي Mus Musculus 10.6٪≤ AR ≤ ٪ 3.8، تليها الزواحف (4.6٪). هذه الأخيرة أقل وفرة ، مثل Gekkonidae sp. ٪ 3.7 و Lacertidae sp 0.8٪. أما بالنسبة للحشرات، فهي الأقل استهلاكًا ٪ ≤ AR ≤ 1.7٪0.9 ، وهذه هي حالة ٪ Gryllotalpa sp. 0.85 و٪ Brachytrupes megacephalus 0.28. من حيث التنوع ، يعتبر Tyto alba مفترسا عامًا من خلال نظام غذائي متنوع مؤشر الإنصاف E = 0.6. وكشف تحليل الحمض النووي ، في الوقت نفسه ، عن وجود 7 أنواع من الفرائس (نوع واحد من الثدييات و 6 أنواع من الحشرات) ، خاصةً منذ تحديد 5 أنواع لم يتم توزيع بعضها بعد أكده التحليل الكلاسيكي مثل Pimelia sp. و Lilioceris sp. و Carpophilus sp. و Attagenus pellio و Calliphora vicina يثبت هذا النهج الجديد أنه مكمل جيد للطريقة الكلاسيكية ، وقد تمكنا من تحديد وجود Brachytrupes megacephalus و Mus Musculus كلتا الطريقتين وفقًا لخصائص كل منهما. نتيجة لذلك ، يظهر تحليل الحمض النووي كأسلوب واعد لاستعادة النظم الغذائية للطيور الجارحة.