Genetic characterization of maize (Zea mays L.) landraces grown in Kosovo assessed by MITE-Hbr markers | Genetska karakterizacija lokalnih sort koruze (Zea mays L.) gojenih na Kosovu ovrednotena z MITE-Hbr označevalci

Inglés. The aim of this study was to examine and describe genetic structure on autochthonous maize germplasm (flint types) from different localities in Kosovo using Hbr markers. The genetic characterization of 6-8 individual seedlings per each of 20 landraces was conducted by Hbr display calculated per selective base, the most efficient genetic diversity estimator to distinguish between landraces was primer combination Hbr-Int5-F/MseI+T. The strongest genetic relatedness (r = 55.57) had landrace ACC4 having orange colored seeds, showing the highest genetic uniformity when compared to other accessions. Clustering analysis using the Bayesian approach generated two genetic clusters for observed landraces. As a measure of population structure influenced by genetic drift and migration, Fst values for each genetic cluster were obtained. Higher Fst (0.4027) was calculated within the first genetic group comparing to the second one (0.2001), reflecting a higher levels of out-crossing and conservation between landraces from the first genetic cluster. A similar distribution of genetic linkages was observed from dendrogram, constructed using Dice coefficient and neighbour-joining (NJ) algorithm with minor deviations for landraces ACC6 and ACC28. Genotypes of ACCmk landrace reveal the highest genetic distinction compared to other genotypes, reflecting the highest number of bands (241) and the highest number of private bands (10) as the number of bands unique to a single population, respectively.

Esloveno. Namen raziskave je bil preučiti in opisati genetsko strukturo avtohtone dednine trdinke iz različnih lokalitet Kosova s Hbr označevalci. Genetska karakterizacija 6-8 sejank od vsake lokalne sorte je bila izvedena s prikazom nabora Hbr profilov, izračunanega na osnovi selektivne baze. Najučinkovitejši določitelj genetske raznovrstnosti za razločevanje med lokalnimi sortami je bila kombinacija primerjev Hbr-Int5-F/MseI+T. Najmočnejšo genetsko povezanost med genotipi (r = 55.57) je imela lokalna sorta ACC4 z oranžnimi zrni, ki je izkazovala največjo genetsko izenačenost v primerjavi z drugimi akcesijami. Klasterska analiza z uporabo modela aposteriorne verjetnosti (Bayesian approach) je za vključene lokalne sorte oblikovala dve genetski skupini. Kot merilo za analizo populacijske structure, na katero vplivata genetski zdrs in migracija, so bile izračunane vrednosti Fst za obe genetski skupini. Večja vrednost Fst (0,4027) je bila izračunana znotraj prve genetske skupine v primerjavi z drugo (0,2001), kar kaže na večji delež navskrižnega križanja in ohranjanja raznolikosti med lokalnimi sortami prve genetske skupine grozda. Podobna porazdelitev genetskih povezav je bila določena na dendrogramu, izdelanem z uporabo Dice-ovega koeficienta podobnosti in algoritma razvrščanja po metodi združevanja najbližjih sosedov (NJ) z manjšim odstopanjem za akcesiji ACC6 in ACC28. Genotipi akcesije ACCmk so se genetsko najbolj razlikovali od drugih na osnovi največjega števila prisotnih namnožkov (241) in največjega števila prisotnih “privatnih namnožkov” (10) in v številu namnožkov, ki so bili omejeni samo na eno populacijo.