STANDARDIZATION PROTOCOLS FOR EXTRACTING CHROMOSOMAL DNA OF colletotrichum gloeosporioides STRAINS ISOLATED IN MANGO PLANTS (Mangifera indica L.) | ESTANDARIZACIÓN DE PROTOCOLOS PARA LA EXTRACCIÓN DE ADN CROMOSÓMICO EN CEPAS DE colletotrichum gloeosporioides AISLADOS EN PLANTAS DE MANGO (Mangifera indica l.).

Inglés. Colletotrichum gloeosporioides (Penz) Penz & Sacc. is responsible for anthracnose in mango, a disease that affects all aerial parts of the plant, causing losses of up to 12 % of production. Microbial identification and characterization is important for determining prevention and pathogen control measure in plantations. This research aimed to standardize protocols for isolation of genomic DNA in strains of Colletotrichum gloeosporioides (Penz) Penz & Sacc., to ensure quality and concentration for future molecular studies in different representatives of this fungal species. Isolation of genomic DNA was performed by three methods: CTAB Doyle y Doyle (1990); Kuramane-Izioka (1997) with modifications and CTAB California modified by Ramirez et al., (2004) combined with NucleoSpin commercial reagent kits. The quality of the DNA obtained was tested by absorbance measurement at 260 and 280nm. The first method was not effective while the other methods yielded were obtained with genomic DNA with the appropriate concentrations for molecular research on the species. Modifications to the Kuramane-Izioka (1997) method, contributed to its effectiveness. The California CTAB method modified by Ramirez et al. (2004) constitutes the first report of its use for representatives of the Fungi kingdom.

Español; castellano. Colletotrichum gloeosporioides (Penz) Penz & Sacc. es la especie responsable de la antracnosis en el mango; esta enfermedad afecta toda la parte aérea de la planta, produciendo pérdidas hasta de 12% de la producción. La identificación y caracterización microbiana es importante para la toma de medidas de prevención y control del patógeno en plantaciones. Esta investigación tuvo como objetivo estandarizar  protocolos de aislamiento de ADN genómico en cepas de Colletotrichum gloeosporioides (Penz) Penz & Sacc., que garantice calidad y concentración para futuros trabajos moleculares en diferentes representantes de esta especie fúngica. El aislamiento de ADN genómico se realizó por  tres metodologías: CTAB Doyle y Doyle (1990), Kuramane-Izioka (1997) con modificaciones y CTAB California modificado por Ramírez et al., (2004) conjugadas con juegos de reactivos comerciales NucleoSpin. La calidad del ADN obtenido fue comprobada por absorbancia medida a 260 y 280nm.  El primero de los métodos no resultó efectivo mientras que con los otros se obtuvo ADN genómico con la calidad y concentraciones adecuadas para investigaciones  moleculares con la especie. Las modificaciones realizadas al método Kuramane-Izioka (1997), contribuyeron a la efectividad del mismo. El método CTAB California modificado por Ramírez et al., (2004) constituye el primer informe de su uso para representantes del reino Fungi.