Potential effectiveness of Vitrakvi (Larotrectinib) for treating types of solid tumors carrying NTRK genes and the impact of TRKC mutations | Eficacia de Vitrakvi (Larotrectinib) para el tratamiento de tumores sólidos portadores de genes NTRK y el impacto de las mutaciones TRKC | Eficacia de Vitrakvi (Larotrectinib) para el tratamiento de tumores sólidos portadores de genes NTRK y el impacto de las mutaciones TRKC

Inglés. Vitrakvi is a cancer treatment that targets solid tumors with NTRK gene fusion. NTRKs are rare genetic effects that can arise in tumors from several organs, including the lungs, thyroid glands, and intestines. This study sought to identify the position at which Vitrakvi binds to tropomyosin receptor kinases (TRKs) as well as the effects of TRKC mutations on the fusion site. Materials and PubChem were used to obtain the chemical structure of Vitrakvi. The 3D structure of TRKs was derived from the PDB. Docking was implemented via AutoDock Vina. Docking, visualization, and sequence reconstruction were completed via the PyMol, BIOVIA, and PyRx programs. The fusion of Vitrakvi with TRKA and TRKB is altered if they are combined with their respective stimulators (BDGF and NT-4/5). TRKC combines with Vitrakvi in the same chain in which it is coupled to its stimulator (NT-3), but the fusion site shifts away from the triple mutation site. Even though clinical trials of TRK inhibitors have just started, there is reason to be hopeful for people with TRK mutations and the field of molecularly targeted medicines.

Español; castellano. Vitrakvi es un tratamiento oncológico dirigido a tumores sólidos que presentan fusiones génicas del gen NTRK. Las alteraciones en los genes NTRK constituyen efectos genéticos poco comunes que pueden manifestarse en tumores originados en diversos órganos, incluidos los pulmones, las glándulas tiroideas y el intestino. El objetivo de este estudio fue identificar el sitio de unión de Vitrakvi a las quinasas del receptor de tropomiosina (TRK), así como evaluar los efectos de las mutaciones en TRKC sobre el sitio de fusión. Para obtener la estructura química de Vitrakvi se utilizaron recursos como PubChem, y la estructura tridimensional de las TRK se obtuvo del Protein Data Bank (PDB). El acoplamiento molecular (docking) se llevó a cabo mediante el programa AutoDock Vina. Las simulaciones de acoplamiento, visualización y reconstrucción de las secuencias se realizaron utilizando los programas PyMol, BIOVIA y PyRx. La fusión de Vitrakvi con TRKA y TRKB se ve modificada cuando estas quinasas se combinan con sus respectivos estimuladores (BDGF y NT-4/5). En el caso de TRKC, la unión con Vitrakvi ocurre en la misma cadena que se acopla a su estimulador (NT-3); sin embargo, el sitio de fusión se desplaza respecto al sitio de la triple mutación. Aunque los ensayos clínicos con inhibidores de TRK se encuentran en fases iniciales, existen fundamentos prometedores para la esperanza tanto en pacientes con mutaciones en TRK como en el campo de las terapias dirigidas molecularmente.

Portugués. Vitrakvi es un tratamiento oncológico dirigido a tumores sólidos que presentan fusiones génicas del gen NTRK. Las alteraciones en los genes NTRK constituyen efectos genéticos poco comunes que pueden manifestarse en tumores originados en diversos órganos, incluidos los pulmones, las glándulas tiroideas y el intestino. El objetivo de este estudio fue identificar el sitio de unión de Vitrakvi a las quinasas del receptor de tropomiosina (TRK), así como evaluar los efectos de las mutaciones en TRKC sobre el sitio de fusión. Para obtener la estructura química de Vitrakvi se utilizaron recursos como PubChem, y la estructura tridimensional de las TRK se obtuvo del Protein Data Bank (PDB). El acoplamiento molecular (docking) se llevó a cabo mediante el programa AutoDock Vina. Las simulaciones de acoplamiento, visualización y reconstrucción de las secuencias se realizaron utilizando los programas PyMol, BIOVIA y PyRx. La fusión de Vitrakvi con TRKA y TRKB se ve modificada cuando estas quinasas se combinan con sus respectivos estimuladores (BDGF y NT-4/5). En el caso de TRKC, la unión con Vitrakvi ocurre en la misma cadena que se acopla a su estimulador (NT-3); sin embargo, el sitio de fusión se desplaza respecto al sitio de la triple mutación. Aunque los ensayos clínicos con inhibidores de TRK se encuentran en fases iniciales, existen fundamentos prometedores para la esperanza tanto en pacientes con mutaciones en TRK como en el campo de las terapias dirigidas molecularmente.