Guidance framework to apply best practices in ecological data analysis: lessons learned from building Galaxy-Ecology

Royaux, Coline | Mihoub, Jean-Baptiste | Jossé, Marie | Pelletier, Dominique | Norvez, Olivier | Reecht, Yves | Fouilloux, Anne | Rasche, Helena | Hiltemann, Saskia | Batut, Bérénice | Marc, Eléaume | Seguineau, Pauline | Massé, Guillaume | Amossé, Alan | Bissery, Claire | Lorrilliere, Romain | Martin, Alexis | Bas, Yves | Virgoulay, Thimothée | Chambon, Valentin | Arnaud, Elie | Michon, Elisa | Urfer, Clara | Trigodet, Eloïse | Delannoy, Marie | Loïs, Grégoire | Julliard, Romain | Grüning, Björn | Le Bras, Yvan | Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA) ; Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Patrimoine naturel (PatriNat) ; Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-OFB Direction surveillance, évaluation,données (OFB - DSUED) ; Office français de la biodiversité (OFB)-Office français de la biodiversité (OFB) | Centre d'Ecologie et des Sciences de la COnservation (CESCO) ; Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Unité Mixte Data Terra (Data Terra) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut National de l'Information Géographique et Forestière [IGN] (IGN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National d’Études Spatiales [Paris] (CNES)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Météo-France | Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l’océan (DECOD) ; Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | Fondation pour la recherche sur la Biodiversité (FRB) | Institute of Marine Research [Bergen] (IMR) ; University of Bergen (UiB) | Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER) | Simula Research Laboratory [OSLO] | Erasmus University Medical Center [Rotterdam] (Erasmus MC) | Albert-Ludwigs-Universität Freiburg = University of Freiburg | Institut Français de Bioinformatique (IFB-core) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi) ; Mésocentre Clermont Auvergne ; Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA) | Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB) ; Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA) | Variabilité de l'Océan et de la Glace de mer (LOCEAN-VOG) ; Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN) ; Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)) ; École normale supérieure - Paris (ENS-PSL) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X) ; Institut Polytechnique de Paris (IP Paris)-Institut Polytechnique de Paris (IP Paris)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X) ; Institut Polytechnique de Paris (IP Paris)-Institut Polytechnique de Paris (IP Paris)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)) ; École normale supérieure - Paris (ENS-PSL) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X) ; Institut Polytechnique de Paris (IP Paris)-Institut Polytechnique de Paris (IP Paris)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X) ; Institut Polytechnique de Paris (IP Paris)-Institut Polytechnique de Paris (IP Paris)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité) | Station de Biologie Marine de Concarneau ; Direction générale déléguée à la Recherche, à l’Expertise, à la Valorisation et à l’Enseignement-Formation (DGD.REVE) ; Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN) | Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon | Université de Montpellier (UM) | Institut des Sciences de la MER de Rimouski (ISMER) ; Université du Québec à Rimouski (UQAR) | Université de Brest (UBO) | European Project: H2020 EOSC-Pillar