Diversity of Trichoderma species in association with banana and weed roots in southeast Mexico | Diversidad de especies de Trichoderma en asociación con raíces de banano y malezas en el sureste de México

Inglés. Background. Cultivated plants and weeds play an important role in interacting with soil microorganisms, which, together with climatic and edaphic conditions, characterize the ecological niches of microorganisms such as Trichoderma. Objective. It was to determine the abundance and diversity of Trichoderma species with endophytic and epiphytic association in the root of five varieties of banana and weed in the states of Oaxaca, Veracruz, and Puebla, Mexico. Methodology. For the study, a total of 60 samples of banana root and weeds were collected, and from 3 to 7 samples per plot in which the pH and organic matter were measured. The endophytic and epiphytes fungi root was isolated, and these were characterized morphologically and molecularly. For the diversity analysis, the Shannon-Wiener (H') and Simpson indexes were used, and the frequency of species was calculated. Results. A total of 23 isolates were obtained, of which 21 were Trichoderma longibrachiatum, one of them Trichoderma reesei and other Trichoderma harzianum, and 61% of 23 isolates were epiphytes and 39% endophytes, and only the T. longibrachiatum specie showed both behaviors. Likewise, T. longibrachiatum was isolated in all the banana varieties analyzed as well as in weeds, and it had 100% presence in the enano gigante, macho Papaloapan, and macho chifle varieties, while in banana apple tree and purple varieties were obtained T. harzianum and T. reesei in 8% and 50% respectively. Of the total isolates, 70% were obtained from bananas and 30% from weeds, and none of them were endophytic in weeds. The highest abundance index AI= 0.1 was to Veracruz, which had pH=7.1 and O.M.=2.8-5.7, however, the diversity index in it was 0, the highest diversity indices were H=0.3, 0.2, and Ds= 0.67 which were obtained in Puebla state with pH= 6.7 and O.M.= 6.0 to 10 very similar to optimum. Implications. The cultivation of different varieties in each sampled state limited the comparison of determining results in the study. Conclusion. The abundance and diversity of Trichoderma species, as well as their endophytic and epiphytic behavior in banana roots, are influenced by factors such as the plant variety, which is colonized, the non-cultivated plant species found in the area, as well as the pH and the amount of organic matter in the soil. These factors generate inter and intraspecific relationships that intervene in the frequency of occurrence of Trichoderma species.

Español; castellano. Antecedentes. Las plantas cultivadas y malezas desempeñan un papel importante en la interacción con microorganismos del suelo, los cuales, junto con las condiciones climáticas y edáficas caracterizan a los nichos ecológicos de microorganismos como Trichoderma. Objetivo. Determinar la abundancia y diversidad de especies de Trichoderma con asociación endófita y epífita en raíces de cinco variedades de banano y maleza en los estados de Oaxaca, Veracruz y Puebla, México. Metodología. Para realizar el estudio, se colectaron 60 muestras de raíz de banano y maleza y se extrajeron de 3 a 7 muestras de suelo a una profundidad de 30 cm por parcela en la cual se midió el pH y la materia orgánica. Se caracterizaron morfológica y molecularmente los aislados de hongos endófitos y epífitos obtenidos de raíz. Para el análisis de diversidad se usó el índice de Shannon-Wiener (H'), y el de Simpson y se calculó la frecuencia de especies. Resultados. Se obtuvieron 23 aislados, de los cuales 21 fueron de Trichoderma longibrachiatum, uno de Trichoderma reesei y uno de Trichoderma harzianum. El 61% de aislados fueron epífitos y 39% endófitos, y de las tres especies obtenidas, solo T. longibrachiatum mostró ambos comportamientos, además de que se aisló en todas las variedades de banano analizadas, así como en maleza, y obtuvo 100% de presencia en las variedades enano gigante, macho Papaloapan y macho chifle, mientras que en manzano y morado se obtuvo T. harzianum y T. reesei en 8% y 50% respectivamente. Del total de los aislados, 70% fueron obtenidos de banano y 30% de maleza, y ninguno de ellos fue endófito en malezas. El mayor índice de abundancia IA= 0.1 fue en Veracruz con pH de suelo 7.1 y M.O 2.8-5.7; sin embargo, el índice de diversidad en ese mismo estado fue 0 y los mayores índices de diversidad fueron H=0.3, 0.2 y Ds= 0.67 obtenidos en el estado de Puebla con pH 6.7 y M.O de 6.0 a 10 muy cercanos al óptimo. Implicaciones. El cultivo de diferentes variedades de plátano en cada estado muestreado, limitó la comparación de resultados determinantes en el estudio. Conclusión. La abundancia y diversidad de especies de Trichoderma, así como su comportamiento endófito y epífito en raíces de banano se ven influenciadas por factores como la variedad a la que colonizan, malezas encontradas en el área, así como pH y cantidad de materia orgánica del suelo, ya que dichos factores generan relaciones inter e intraespecíficas que intervienen en la frecuencia de ocurrencia de las especies de Trichoderma.