Occurrence of two new groups of Candidatus phytoplasmas infecting soybean in Cuba | Ocurrencia de dos nuevos grupos de Candidatus phytoplasmas infectando cultivos de soya en Cuba

Inglés. New symptoms similar to those induced by phytoplasmas, but different from those reported to date, were observed on soybean plants, so the objective of this research was to determine the possible presence of other groups of phytoplasmas infecting soybean crops in Cuba. Fifty-seven soybean plants showing symptoms of blistering and severe leaf mosaic were collected in several localities of the Cuban eastern region in 2014 and analysed by nested-PCR with primers targeting the 16S ribosomal DNA (16S rDNA). Phytoplasmas were detected in 31.58 % of symptomatic soybean plants. Conventional and in silico RFLP analyses of 16S rDNA sequences revealed the presence of ‘Candidatus Phytoplasma pruni’ and ‘Candidatus Phytoplasma phoenicium’ strains. Phytoplasmas belonging to the proposed new ribosomal subgroup 16SrIII-Z and the ribosomal subgroup 16SrIX-A were identified. Phylogenetic analysis corroborated the RFLP analyses, in which the Cuban 16SrIII-Z and 16SrIX-A subgroups formed a clade with representative sequences of the 16SrIII and 16SrIX groups, respectively. 16SrIII-Z was the most widespread subgroup (72.22 % of positive samples). This is the first report of phytoplasmas belonging to the 16SrIII and 16SrIX groups occurring in soybean in the country.

Español; castellano. Nuevos síntomas similares a las inducidos por fitoplasmas, pero diferentes a los informados hasta la fecha, se observaron en plantas de soya, por lo que el objetivo de esta investigación fue determinar la posible presencia de otros grupos de fitoplasmas infectando los cultivos de soya en Cuba. Cincuenta y siete plantas de soya, que mostraban síntomas de ampollas y mosaico foliar severo, se recolectaron en varias localidades de la región oriental durante 2014 y se analizaron por PCR anidada con cebadores dirigidos al ADN ribosomal 16S (16S rDNA). Se detectaron fitoplasmas en el 31,58 % de las plantas de soya sintomáticas. Los análisis RFLP convencionales e in silico de las secuencias de ADNr 16S revelaron la presencia de las cepas 'Candidatus Phytoplasma pruni' y 'Candidatus Phytoplasma phoenicium'. Se identificaron fitoplasmas pertenecientes al nuevo subgrupo ribosomal propuesto 16SrIII-Z y al subgrupo ribosomal 16SrIX-A. El análisis filogenético corroboró los análisis RFLP, en los que los subgrupos cubanos 16SrIII-Z y 16SrIX-A formaron un clado con secuencias representativas de los grupos 16SrIII y 16SrIX, respectivamente. El 16SrIII-Z fue el subgrupo más extendido (72,22 % de muestras positivas). Este es el primer reporte de fitoplasmas pertenecientes a los grupos 16SrIII y 16SrIX que se presentan en soya en el país.