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Management of dredged marine sediments in Southern France: main keys to large-scale beneficial re-use
2024
Dorleon, Garry | Rigaud, Sylvain | Techer, Isabelle | Détection, évaluation, gestion des risques CHROniques et éMErgents (CHROME) / Université de Nîmes (CHROME) ; Université de Nîmes (UNIMES) | Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS) ; AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Fractionnement des AgroRessources et Environnement (FARE) ; Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
International audience | Abstract Fifty million cubic meters of marine sediments are dredged each year in France in order to maintain harbor activities and sustain the economy of littoral territories. Because of anthropogenic activities in and around harbors, sediments can contain significant amounts of chemical and organic pollutants whose behavior during dredging must be addressed in order to avoid releasing risks for humans and the environment. French regulations come to govern the management of dredged sediments, considering them “safe” and possible to be dumped at sea or “contaminated” and needed to be treated on land as waste. In recent years, new constraints have been pushed toward the management of land. This management is, however, challenging as few channels are proposed to reuse marine sediments, and elimination appears to be economically and environmentally unsustainable. This study provides an overview of the technical and regulatory aspects related to dredged marine sediment management in France and aims to identify and discuss the limits of their valorization. Dredged sediments are mainly composed of particles with heterogeneous grain size, some being known for many applications such as building materials and growing media. However, several reasons have been put forward to explain why these particles are not reused when extracted from dredged sediments. Several technical, socio-economic, and regulatory obstacles explain the low demand for dredged sediments. This demand can be stimulated by government incentives and a good regulatory framework. National regulations could help streamline their reuse by removing their “waste” status and creating a regulated market for dredged sediment.
Mostrar más [+] Menos [-]Characterizing environmental contamination by plant protection products along the land-to-sea continuum:a focus on France and French overseas territories
2024
Margoum, Christelle | Bedos, Carole | Munaron, Dominique | Nélieu, Sylvie | Achard, Anne-Laure | Pesce, Stéphane | RiverLy - Fonctionnement des hydrosystèmes (RiverLy) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS) ; AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | MARine Biodiversity Exploitation and Conservation - MARBEC (UMR MARBEC) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM) | Département Ecosystèmes aquatiques, ressources en eau et risques - INRAE (AQUA) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
International audience | Environmental compartments are contaminated by a broad spectrum of plant protection products (PPPs) that are currently widely used in agriculture or, for some of them, whose use was banned many years ago. The aim of this study is to draw up an overview of the levels of contamination of soils, continental aquatic environments, seawaters and atmosphere by organic PPPs in France and the French overseas territories, based on data from the scientific publications and the grey literature. It is difficult to establish an exhaustive picture of the overall contamination of the environment because the various compartments monitored, the monitoring frequencies, the duration of the studies and the lists of substances are not the same. Of the 33 PPPs most often recorded at high concentration levels in at least one compartment, 5 are insecticides, 9 are fungicides, 15 are herbicides and 4 are transformation products. The PPP contamination of the environment shows generally a seasonal variation according to crop cycles. On a pluriannual scale, the contamination trends are linked to the level of use driven by the pest pressure, and especially to the ban of PPP. Overall, the quality of the data acquired has been improved thanks to new, more integrative sampling strategies and broad-spectrum analysis methods that make it possible to incorporate the search for emerging contaminants such as PPP transformation products. Taking into account additional information (such as the quantities applied, agricultural practices, meteorological conditions, the properties of PPPs and environmental conditions) combined with modelling tools will make it possible to better assess and understand the fate and transport of PPPs in the environment, inter-compartment transfers and to identify their potential impacts. Simultaneous monitoring of all environmental compartments as well as biota in selected and limited relevant areas would also help in this assessment.
Mostrar más [+] Menos [-]Chemical and genotoxic characterization of bioaccessible fractions as a comprehensive in vitro tool in assessing the health risk due to dust-bound contaminant ingestion
2024
Castel, Rebecca | Tassistro, Virginie | Lebarillier, Stépahnie | Dupuy, Nathalie | Noack, Yves | Orsière, Thierry | Malleret, Laure | Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE) ; Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Laboratoire Chimie de l'environnement (LCE) ; Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Centre Européen de Recherche et d'Enseignement des Géosciences de l'Environnement (CEREGE) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | ANR-11-LABX-0010,DRIIHM / IRDHEI,Dispositif de recherche interdisciplinaire sur les Interactions Hommes-Milieux(2011)
International audience
Mostrar más [+] Menos [-]Natural products for biocontrol: review of their fate in the environment and impacts on biodiversity
2024
Amichot, Marcel | Bertrand, Cédric | Chauvel, Bruno | Corio-Costet, M.-F. | Martin-Laurent, Fabrice | Le Perchec, Sophie | Mamy, Laure | Institut Sophia Agrobiotech (ISA) ; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Côte d'Azur (UniCA) | Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement (CRIOBE) ; Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Agroécologie [Dijon] ; Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | Santé et agroécologie du vignoble (UMR SAVE) ; Université de Bordeaux (UB)-Institut des Sciences de la Vigne et du Vin (ISVV)-Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Direction pour la Science Ouverte (DipSO) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS) ; AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
International audience | Biocontrol solutions (macroorganisms, microorganisms, natural substances, semiochemicals) are presented as potential alternatives to conventional plant protection products (PPPs) because they are supposed to have lower impacts on ecosystems and human health. However, to ensure the sustainability of biocontrol solutions, it is necessary to document the unintended effects of their use. Thus, the objectives of this work were to review (1) the available biocontrol solutions and their regulation, (2) the contamination of the environment (soil, water, air) by biocontrol solutions, (3) the fate of biocontrol solutions in the environment, (4) their ecotoxicological impacts on biodiversity, and (5) the impacts of biocontrol solutions compared to those of conventional PPPs. Very few studies concern the presence of biocontrol solutions in the environment, their fate, and their impacts on biodiversity. The most important number of results were found for the organisms that have been used the longest, and most often from the angle of their interactions with other biocontrol agents. However, the use of living organisms (micro and macroorganisms) in biocontrol brings a specific dimension compared to conventional PPPs because they can survive, multiply, move and colonize other environments. The questioning of regulation stems from this specific dimension of the use of living organisms. Concerning natural substances, the few existing results indicate that while most of them have low ecotoxicity, others have a toxicity equivalent to or greater than that of the conventional PPPs. There are almost no result regarding semiochemicals. Knowledge of the unintended effects of biocontrol solutions has proved to be very incomplete. Research remains necessary to ensure their sustainability.
Mostrar más [+] Menos [-]Effects of plant protection products on ecosystem functions provided by terrestrial invertebrates
2024
Bertrand, Colette | Aviron, Stéphanie | Pelosi, Céline | Faburé, Juliette | Le Perchec, Sophie | Mamy, Laure | Rault, Magali | Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS) ; AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Biodiversité agroécologie et aménagement du paysage (UMR BAGAP) ; Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH) ; Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Direction pour la Science Ouverte (DipSO) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE) ; Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
International audience | Plant protection products (PPP) are extensively used to protect plants against harmful organisms, but they also have unintended effects on non-target organisms, especially terrestrial invertebrates. The impact of PPP on ecosystem functions provided by these non-target invertebrates remains, however, unclear. The objectives of this article were to review PPP impacts on the ecosystem functions provided by pollinators, predators and parasitoids, and soil organisms, and to identify the factors that aggravate or mitigate PPP effects. The literature highlights that PPP alter several ecosystem functions: provision and maintenance of biodiversity, pollination, biotic interactions and habitat completeness in terrestrial ecosystems, and organic matter and soil structure dynamics. However, there are still a few studies dealing with ecosystem functions, with sometimes contradictory results, and consequences on agricultural provisioning services remain unclear. The model organisms used to assess PPP ecotoxicological effects are still limited, and should be expanded to better cover the wide functional diversity of terrestrial invertebrates. Data are lacking on PPP sublethal, transgenerational, and “cocktail” effects, and on their multitrophic consequences. In empirical assessments, studies on PPP unintended effects should consider agricultural-pedoclimatic contexts because they influence the responses of non-target organisms and associated ecosystem functions to PPP. Modeling might be a promising way to account for the complex interactions among PPP mixtures, biodiversity, and ecosystem functioning.
Mostrar más [+] Menos [-]Neglected impacts of plant protection products on invertebrate aquatic biodiversity: a focus on eco-evolutionary processes
2024
Coutellec, Marie-Agnès | Chaumot, Arnaud | Sucré, Elliott | Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l’océan (DECOD) ; Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | RiverLy - Fonctionnement des hydrosystèmes (RiverLy) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | MARine Biodiversity Exploitation and Conservation - MARBEC (UMR MARBEC ) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM) | Université de Mayotte (UMay) (UMay) | This work was funded by the French Office for Biodiversity (OFB) through the national Ecophyto plan
International audience | The application of plant protection products (PPPs) may have delayed and long-term non-intentional impacts on aquatic invertebrates inhabiting agricultural landscapes. Such effects may induce population responses based on developmental and transgenerational plasticity, selection of genetic resistance, as well as increased extirpation risks associated with random genetic drift. While the current knowledge on such effects of PPPs is still scarce in non-target aquatic invertebrate species, evidences are accumulating that support the need for consideration of evolutionary components of the population response to PPPs in standard procedures of risk assessment. This mini-review, as part of a contribution to the collective scientific assessment on PPP impacts on biodiversity and ecosystem services performed in the period 2020-2022, presents a brief survey of the current results published on the subject, mainly in freshwater crustaceans, and proposes some research avenues and strategies that we feel relevant to fill this gap.
Mostrar más [+] Menos [-]Determination of the maximum bioaccumulation capacity of various metals in leaves of two Tillandsia species
2024
Gonzalez, Alexandre | Benfodda, Zohra | Bénimélis, David | Bourgeois, Damien | Herfurth, Damien | Fontaine, Jean-Xavier | Molinié, Roland | Meffre, Patrick | Détection, évaluation, gestion des risques CHROniques et éMErgents (CHROME) / Université de Nîmes (CHROME) ; Université de Nîmes (UNIMES) | Systèmes HYbrides pour la Séparation (LHyS) ; Institut de Chimie Séparative de Marcoule (ICSM - UMR 5257) ; Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut des Sciences et technologies pour une Economie Circulaire des énergies bas carbone (ISEC) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Montpellier (UM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM) ; Université de Montpellier (UM)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut des Sciences et technologies pour une Economie Circulaire des énergies bas carbone (ISEC) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Montpellier (UM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM) ; Université de Montpellier (UM) | BioEcoAgro BIOPI-UPJV ; BioEcoAgro - UMR transfrontalière INRAe - UMRT1158 ; Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL)-Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL) | BioEcoAgro - UMR transfrontalière INRAe - UMRT1158 ; Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL) | BioEcoAgro - Equipe 5 - Specialized Metabolites of Plant Origin ; BioEcoAgro - UMR transfrontalière INRAe - UMRT1158 ; Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL)-Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL) | Université de Nîmes (UNIMES)
International audience | Tillandsia species are plants from the Bromeliaceae family which display biomonitoring capacities in both active and passive modes. The bioaccumulation potential of Tillandsia aeranthos (Loisiel.) Desf. and Tillandsia bergeri Mez acclimated to Southern/Mediterranean Europe has never been studied. More generally, few studies have detailed the maximum accumulation potential of Tillandsia leaves through controlled experiments. The aim of this study is to evaluate the maximum accumulation values of seven metals (Co, Cu, Mn, Ni, Pb, Pt, and Zn) in T. aeranthos and T. bergeri leaves. Plants were immersed in different mono elemental metallic solutions of Co (II), Cu (II), Mn (II), Ni (II), Pb (II), Pt (IV), and Zn (II) ions at different concentrations. In addition, cocktail solutions of these seven metals at different concentrations were prepared to study the main differences and the potential selectivity between metals. After exposure, the content of these metals in the leaves were measured by inductively coupled plasma-optical emission spectrometry. Data sets were evaluated by a fitted regression hyperbola model and principal component analysis, maximum metal loading capacity, and thermodynamic affinity constant were determined. The results showed important differences between the two species, with T. bergeri demonstrating higher capacity and affinity for metals than T. aeranthos. Furthermore, between the seven metals, Pb and Ni showed higher enrichment factors (EF). T. bergeri might be a better bioaccumulator than T. aeranthos with marked selectivity for Pb and Ni, metals of concern in air quality biomonitoring.
Mostrar más [+] Menos [-]Aqueous phase recycling: impact on microalgal lipid accumulation and biomass quality
2024
Ramírez-Romero, Adriana | da Costa Magalhaes, Bruno | Matricon, Lucie | Sassi, Jean-Francois | Steyer, Jean-Philippe | Delrue, Florian | CEA Tech en région Sud (DSUD) ; CEA Tech en régions (CEA-TECH-Reg) ; Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | IRCELYON-Catalyse Hétérogène pour la Transition Energétique (CATREN) ; Institut de recherches sur la catalyse et l'environnement de Lyon (IRCELYON) ; Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Laboratoire d'Innovation pour les Technologies des Energies Nouvelles et les nanomatériaux (LITEN) ; Institut National de L'Energie Solaire (INES) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | Laboratoire d'Innovation pour les Technologies des Energies Nouvelles et les nanomatériaux (LITEN / CEA-DES) ; CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de L'Energie Solaire (INES) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | CEA Cadarache ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | ANR-18-CE43-0009,RAFBIOALG,Raffinage catalytique des bio-huiles obtenues par liquéfaction hydrothermale de micro-algues(2018)
fff | International audience | The potential success of microalgal biofuels greatly depends on the sustainability of the chosen pathway to produce them. Hydrothermal liquefaction (HTL) is a promising route to convert wet algal biomass into biocrude. Recycling the resulting HTL aqueous phase (AP) aims not only to recover nutrients from this effluent but also to use it as a substrate to close the photosynthetic loop and produce algal biomass again and process this biomass again into new biocrude. With that purpose, the response to AP recycling of five Chlorellaceae strains was monitored over five cultivation cycles. After four successive cycles of dynamic growth under nutrient-replete conditions, the microalgae were cultivated for a prolonged fifth cycle of 18 days in order to assess the impact of the AP on lipid and biomass accumulation under nutrient-limited conditions. Using AP as a substrate reduced the demand for external sources of N, S, and P while producing a significant amount of biomass (2.95-4.27 g/L) among the strains, with a lipid content ranging from 16 to 36%. However, the presence of the AP resulted in biomass with suboptimal properties, as it slowed down the accumulation of lipids and thus reduced the overall energy content of the biomass in all strains. Although Chlorella vulgaris NIES 227 did not have the best growth on AP, it did maintain the best lipid productivity of all the tested strains. Understanding the impact of AP on microalgal cultivation is essential for further optimizing biofuel production via the HTL process.
Mostrar más [+] Menos [-]Tracking antimicrobial resistance indicator genes in wild flatfish from the English Channel and the North Sea area: a One Health concern
2024
Bourdonnais, Erwan | Le Bris, Cédric | Brauge, Thomas | Midelet, Graziella | Bactériologie et Parasitologie des Produits de la Pêche et de l’Aquaculture (B3PA) ; Laboratoire de sécurité des aliments, sites de Maisons-Alfort et de Boulogne-sur-Mer (LSAl) ; Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES) | BioEcoAgro - UMR transfrontalière INRAe - UMRT1158 ; Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL) | BioEcoAgro - Equipe 8 - Food and Digestive Microbial Ecosystems: Interactions - Dynamics - Application(s) ; BioEcoAgro - UMR transfrontalière INRAe - UMRT1158 ; Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL)-Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL) | Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO) | This study was supported by a doctoral fellowship from Région Hauts-de-France and Pôle Métropolitain de la Côte d’Opale (PMCO).
International audience | Antimicrobial resistance (AMR) is a burgeoning environmental concern demanding a comprehensive One Health investigation to thwart its transmission to animals and humans, ensuring food safety. Seafood, housing bacterial AMR, poses a direct threat to consumer health, amplifying the risk of hospitalization, invasive infections, and death due to compromised antimicrobial treatments. The associated antimicrobial resistance genes (ARGs) in diverse marine species can amass and transmit through various pathways, including surface contact, respiration, and feeding within food webs. Our research, focused on the English Channel and North Sea, pivotal economic areas, specifically explores the occurrence of four proposed AMR indicator genes (tet(A), blaTEM, sul1, and intI1) in a benthic food web. Analyzing 350 flatfish samples' skin, gills, and gut, our quantitative PCR (qPCR) results disclosed an overall prevalence of 71.4% for AMR indicator genes. Notably, sul1 and intI1 genes exhibited higher detection in fish skin, reaching a prevalence of 47.5%, compared to gills and gut samples. Proximity to major European ports (Le Havre, Dunkirk, Rotterdam) correlated with increased AMR gene frequencies in fish, suggesting these ports' potential role in AMR spread in marine environments. We observed a broad dispersion of indicator genes in the English Channel and the North Sea, influenced by sea currents, maritime traffic, and flatfish movements. In conclusion, sul1 and intI1 genes emerge as robust indicators of AMR contamination in the marine environment, evident in seawater and species representing a benthic food web. Further studies are imperative to delineate marine species' role in accumulating and transmitting AMR to humans via seafood consumption. This research sheds light on the urgent need for a concerted effort in comprehending and mitigating AMR risks in marine ecosystems within the context of One Health.
Mostrar más [+] Menos [-]Microplastics in the insular marine environment of the Southwest Indian Ocean carry a microbiome including antimicrobial resistant (AMR) bacteria: A case study from Reunion Island
2024
Sababadichetty, Loik | Miltgen, Guillaume | Vincent, Bryan | Guilhaumon, François | Lenoble, Véronique | Thibault, Margot | Bureau, Sophie | Tortosa, Pablo | Bouvier, Thierry | Jourand, Philippe | Ecologie marine tropicale dans les Océans Pacifique et Indien (ENTROPIE [Réunion]) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de La Réunion (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion (CHU La Réunion) | Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical (PIMIT) ; Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IRD-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Laboratoire des symbioses tropicales et méditerranéennes (UMR LSTM) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM) | Institut méditerranéen d'océanologie (MIO) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | The Ocean Cleanup | Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP) ; Institut de Chimie de Toulouse (ICT) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement - CNRS Ecologie et Environnement (INEE-CNRS) ; Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT) ; Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse) ; Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse) ; Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Cyclotron Réunion Océan Indien (CYROI) ; Université de La Réunion (UR)-Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion (CHU La Réunion) | MARine Biodiversity Exploitation and Conservation - MARBEC (UMR MARBEC ) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM) | This study was supported by funds from the Structure Federative de Recherche Biosecurite en milieu Tropical (BIOST), Universite de la Reunion (France) and Institut de Recherche pour le Developpement (IRD). Project ID: BMRPLAST.
NGS raw data 16SrDNA sequences are deposited in zenodo data bank: https://doi.org/10.5281/zenodo.8063253. | International audience | The increasing threats to ecosystems and humans from marine plastic pollution require a comprehensive assessment. We present a plastisphere case study from Reunion Island, a remote oceanic island located in the Southwest Indian Ocean, polluted by plastics. We characterized the plastic pollution on the island's coastal waters, described the associated microbiome, explored viable bacterial flora and the presence of antimicrobial resistant (AMR) bacteria. Reunion Island faces plastic pollution with up to 10,000 items/km 2 in coastal water. These plastics host microbiomes dominated by Proteobacteria (80 %), including dominant genera such as Psychrobacter, Photobacterium, Pseudoalteromonas and Vibrio. Culturable microbiomes reach 10 7 CFU/g of microplastics, with dominance of Exiguobacterium and Pseudomonas. Plastics also carry AMR bacteria including β-lactam resistance. Thus, Southwest Indian Ocean islands are facing serious plastic pollution. This pollution requires vigilant monitoring as it harbors a plastisphere including AMR, that threatens pristine ecosystems and potentially human health through the marine food chain.
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