Comparison of differentially selected maize genotypes for flooding tolerance using molecular markers [Zea mays L.; Brazil]
2005
Dejalma Zimmer, P. (Universidade Federal de Pelotas (Brazil). Centro de Genomica e Fitomelhoramento) | Costa de Oliveira, A. (Universidade Federal de Pelotas (Brazil). Centro de Genomica e Fitomelhoramento) | Irajá Félix de Carvalho, F. (Universidade Federal de Pelotas (Brazil). Centro de Genomica e Fitomelhoramento) | Pereira Porto, M. (Universidade Federal de Pelotas (Brazil). Centro de Genomica e Fitomelhoramento) | Delmar dos Anjos Silva, S. (Universidade Federal de Pelotas (Brazil). Centro de Genomica e Fitomelhoramento) | Barbosa Neto, J.F. (Universidade Federal de Pelotas (Brazil). Centro de Genomica e Fitomelhoramento) | Marini Kopp, M. (Universidade Federal de Pelotas (Brazil). Centro de Genomica e Fitomelhoramento) | Malone, G. (Universidade Federal de Pelotas (Brazil). Centro de Genomica e Fitomelhoramento)
anglais. This study was carried out to evaluate the levels of genetic variation among 36 maize lines, tolerant and susceptible to flooding, using SSR and RAPD molecular marker techniques. Fifteen SSR primers and 21 RAPD primers were employed to analyze polymorphisms among genotypes. For SSR data two analyses were performed, clustering and polymorphism information content (PIC), while for RAPD only the clustering method was performed. PIC values ranged from 0 to 0.93, with an average of 0.76. There were no differences between PIC values from susceptible and tolerant genotypes. RAPD data showed a genetic similarity varying from 0.48 to 0.80 and SSR data showed a genetic similarity varying from 0.40 to 0.75. Cophenetic correlations between dendrograms and similarity matrixes were 0.70 and 0.65 for RAPD and SSR, respectively. There is a large amount of genetic variability among the maize lines used in this study. From the results obtained from RAPD and SSR, it was found that SSR markers are more informative in detecting genetic dissimilarity. The clustering patterns observed indicate that sufficient molecular polymorphism is present in the collection and potential intercrosses will involve lines from contrasting groups from which candidates for parents of a mapping population can be identified
Afficher plus [+] Moins [-]italien. [Questo studio è stato effettuato per valutare i livelli di variazione genetica nell'ambito di 36 linee di mais, tolleranti e suscettibili all'allagamento, utilizzando tecniche basate sui marcatori molecolari SSR e RAPD. Sono stati impiegati 15 primer SSR e 21 primer RAPD per analizzare il polimorfismo fra i genotipi. Per i dati SSR sono state effettuate due analisi, clustering e contenuto informativo del polimorfismo (PIC), mentre per i RAPD è stato adottato solo il metodo del clustering. I valori del PIC variavano da 0 a 0,93, con una media di 0,76. Non sono state rilevate differenze fra i valori del PIC fra i genotipi suscettibili e quelli tolleranti. I dati relativi ai RAPD presentavano una similarità genetica variabile da 0,48 a 0,80 e i dati degli SSR evidenziavano una similarità genetica variabile da 0,40 a 0,75. Le relazioni co-fenetiche fra i dendrogrammi e le matrici di similarità erano 0,70 e 0,65 per RAPD e SSR, rispettivamente. Esiste una notevole variabilità genetica fra le linee di mais utilizzate in questo studio. Dai risultati ottenuti dai marcatori RAPD e SSR, si è riscontrato che i marcatori SSR sono maggiormente informativi ai fini dell'individuazione della diversità genetica. I tipi di clustering osservati indicano che nella collezione è presente un sufficiente polimorfismo molecolare e che incroci potenziali interesseranno linee derivanti da gruppi contrastanti nell'ambito dei quali possono essere identificati parentali per una popolazione di mappatura.]
Afficher plus [+] Moins [-]Mots clés AGROVOC
Informations bibliographiques
Cette notice bibliographique a été fournie par Istituto di Servizi per il Mercato Agricolo Alimentare
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