Haplotype polymorphism among Egyptian wheat varieties based on microsatellites near Lr34/7DS QTL region [Triticum aestivum L.; Quantitative Trait Loci]
2005
Fahmi, A.I.
anglais. Twenty nine Egyptian wheat varieties, nullisomic-tetrasomic lines N7BT7A, N7AT7B and N7BT7D, ditelosomic line 7DS and 7DS deletion lines 7DS4-0.61, 7DS5-0.36 and 7DS6-0.73 were subjected to microsatellite analysis using microsatellite markers Xgwm130, Xgwm295, Xgwm350, Xgwm635, Xbarc125, Xbarc126, Xbarc154 and Xbarc1033 mapped on chromosome arm 7DS. A total of 32 alleles were detected, the number of alleles per locus ranging from 2 to 7, with a mean value over all eight loci of four alleles per locus. Gene diversity or polymorphic information content (PIC) per locus ranged from 0.25 for Xbarc1033 to 0.81 for Xgwm350, with an average PIC value for all loci of 0.58. Allele number and PIC values indicated that it should be possible to obtain adequate polymorphism in crosses between the varieties under study to map the leaf rust genes of resistance on this chromosome arm. Also, the set of eight microsatellites has been proven to be useful for DNA fingerprinting of the wheat varieties under study. The alleles of markers Xgwm130 (125), Xgwm295 (240 and 250), Xgwm350 (150), Xgwm635 (100), Xbarc126 (115) and Xbarc154 (220 and 235) were mapped to deletion bin 7DS4-0.61 and 7DS5-0.36. Since the Xgwm295 (250) is closely linked to Xgwm295 (250) Lr34/7DS QTL, then this locus must locate in the DNA segment between the breakpoints 7DS4-0.61 and 7DS5-0.36. Nineteen varieties were found to contain the Xgwm295 (250) allele, suggesting that they likely contain the Lr34/7DS QTL
Afficher plus [+] Moins [-]italien. [Ventinove varietà egiziane di frumento, le linee nullisomiche-tetrasomiche N7BT7A, N7AT7B e N7BT7D, la linea ditelosomica 7DS e le linee con delezione 7DS 7DS4-0.61, 7DS5-0.36 e 7DS6-0.73 sono state sottoposte all'analisi dei microsatelliti utilizzando i marcatori microsatellite Xgwm130, Xgwm295, Xgwm350, Xgwm635, Xbarc125, Xbarc126, Xbarc154 e Xbarc1033 mappati sul braccio del cromosoma 7DS. E' stato individuato un totale di 32 alleli; il loro numero per locus variava da 2 a 7, con un valore medio, su tutti gli 8 loci, di 4 alleli per locus. La diversità genica o contenuto informativo polimorfico (PIC) variava da 0,25 per Xbarc1033 a 0,81 per Xgwm350, con un valore medio di PIC pari a 0,58 per tutti i loci. Il numero di alleli e i valori del PIC indicavano che sarebbe possibile ottenere un adeguato polimorfismo in incroci fra le varietà studiate per mappare i geni di resistenza alla ruggine delle foglie su questo braccio del cromosoma. Inoltre, è stati dimostrato che il gruppo di 8 microsatelliti è utile per la tipizzazione del DNA delle varietà di frumento studiate. Gli alleli dei marcatori Xgwm130 (125), Xgwm295 (240 e 250), Xgwm350 (150), Xgwm635 (100), Xbarc126 (115) e Xbarc154 (220 e 235) sono stati mappati al sito della delezione 7DS4-0.61 e 7DS5-0.36. Dal momento che Xgwm295 (250) è strettamente concatenato con Xgwm295 (250) Lr34/7DS QTL, questo locus deve localizzarsi nel segmento di DNA fra i punti di rottura 7DS4-0.61 e 7DS5-0.36. Si è accertato che diciannove varietà contengono l'allele Xgwm295 (250), facendo ritenere che esse probabilmente contengano il Lr34/7DS QTL.]
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Informations bibliographiques
Cette notice bibliographique a été fournie par Istituto di Servizi per il Mercato Agricolo Alimentare
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