Molecular characterization of Pseudomonas syringae pv. syringae strains from different host plants using fluorescent amplified fragment length polymorphism [fAFLP]

anglais. The ability of fluorescent Amplified Fragment Length Polymorphism (fAFLP) technique for typing Pseudomonas syringae pv. syringae strains isolated from different host plants was investigated. Fragments up to 700 bp were separated on a CEQ 8000 automated DNA sequencer and electropherograms were generated with CEQ 8000 analysis software. Different patterns were generated from 57 P. s. pv. syringae strains examined and seven fAFLP clusters partially corresponding to the host of origin were identified. The analysis of the electropherograms allowed the identification of host-specific discriminative peaks. One peak was present in 93% of the analyzed strains. fAFLP analysis showed an high genetic heterogeneity in the examined P. s. pv. syringae strains, including strains isolated from the same host

italien. [E' stata studiata la capacità della tecnica del Polimorfismo dei Frammenti Amplificati fluorescente (fAFLP) nella tipizzazione di ceppi di Pseudomonas syringae pv. syringae isolati da piante ospiti diverse. Frammenti fino a 700 bp sono stati separati su un sequenziatore di DNA automatizzato CEQ 8000 e sono stati generati elettroferogrammi con il software di analisi del CEQ 8000. Sono stati generati profili diversi da 57 ceppi di P. s. pv. syringae esaminati e sono stati identificati sette cluster fAFLP parzialmente corrispondenti all'ospite di origine. L'analisi degli elettroferogrammi ha consentito l'identificazione di picchi discriminanti ospite-specifici. Un picco era presente nel 93% dei ceppi analizzati. L'analisi fAFLP ha evidenziato un'elevata eterogeneità genetica nei ceppi di P. s. pv. syringae analizzati, compresi ceppi isolati dal medesimo ospite.]