Genetic fingerprinting of Latvian red clover (Trifolium pratense L.) varieties using simple sequence repeat (SSR) markers: comparisons over time and space | Latvijas sarkanā āboliņa (Trifolium pratense L.) šķirņu ģenētiskā pasportizācija: vietas un laika ietekme uz ģenētisko daudzveidību

anglais. We have established Simple Sequence Repeat (SSR) marker genetic fingerprinting protocols for red clover (Trifolium pratense L.) varieties found in the Latvian Gene Bank (LGB). As red clover is an obligate outcrosser, and the varieties are grown and renewed in the field without any particular isolation techniques, a high degree of intra-varietal heterogeneity is to be expected. We analysed 7 diploid varieties, which were developed in three different breeding stations. We tested seeds from these varieties that were placed into the LGB in 1999 and 2000. In addition, we analysed a range of source material for one variety (‘Prieku’i 66’). For this variety, we tested seeds that were repatriated from the VIR institute (placed into the VIR collection in 1982, seeds reproduced in 2005), the samples from the LGB (seed reproduction - 1997), and also plant material grown in the field this year (2007). By analysing samples from various sources, we can examine the effect of space (varieties developed at different breeding stations), as well as time (repatriated seeds, LGB seeds, and current crop), in an obligate outcrossing crop species, where intra-varietal heterogeneity is high.

letton. Ģenētisko resursu centrā ir izstrādāta ģenētiskas pasportizācijas metodika Latvijas gēnu bankā (LGB) uzglabātām sarkanā āboliņa šķirnēm. Sarkanais āboliņš ir svešapputes augs un Ņemot vērā, ka šķirnes ir audzētas un atjaunotas bez īpašām izolācijas metodēm, šķirnes robežās ir sagaidāma augsta ģenētiskā daudzveidība. Izpētītas septiņas diploīdā sarkanā āboliņa šķirnes, kuras izveidotas trīs Latvijas selekcijas institūtos. Tika analizētas sēklas, kuras ievietotas LGB 1999.g. un 2000.g. Šķirnei 'Priekuļu 66' tika analizētas no VIR repatriētās sēklas (ievietotas VIR kolekcijā 1982.g.), Latvijas gēnu bankas sēklas (1999.g.), kā arī augi no Priekuļu lauka kolekcijas 2007. gadā. Šāda dažādu avotu svešapputes augu ar augstu ģenētiskā daudzveidību analīze ļauj izpētīt ģeogrāfisko ietekmi uz ģenētisko daudzveidību (šķirnes izveidotas dažādos selekcijas institūtos), kā arī to izmaiņas laikā (repatriētās sēklas, LGB sēklas un lauku augi).