The grapevine genome sequence suggests ancestral hexaploidization in major angiosperm phyla
2007
Jaillon , Olivier (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Aury , Jean-Marc (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Noel , Benjamin (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Policriti , Alberto (Istituto di Genomica ApplicataUniversità degli Studi di Udine, UDINEUDINE(Italie). Dipartimento di Matematica ed Informatica) | Clepet , Christian (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Casagrande , Alberto (Istituto di Genomica ApplicataUniversità degli Studi di Udine, UDINEUDINE(Italie). Dipartimento di Scienze Agrarie ed Ambientali) | Choisne , Nathalie (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Aubourg , Sebastien (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Vitulo , Nicola (Università degli Studi di PadovaUniversità degli Studi di Verona, PADOVAFLORIANO(Italie). CRIBIDipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino) | Jubin , Claire (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Vezzi , Alessandro (Università degli Studi di PadovaUniversità degli Studi di Verona, PADOVAFLORIANO(Italie). CRIBIDipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino) | Legeai , Fabrice (INRA (France). UR 1164 Unité de Recherche Génomique Info) | Hugueney , Philippe (INRA (France). UMR 1131 Santé de la Vigne et Qualité du Vin) | Dasilva , Corinne (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Horner , David (Università degli Studi di MilanoUniversità degli Studi di Verona, MILANOFLORIANO(Italie). Dipartimento di Scienze Biomolecolari e BiotecnologieDipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino) | Mica , Erica (Università degli Studi di MilanoUniversità degli Studi di Verona, MILANOFLORIANO(Italie). Dipartimento di Scienze Biomolecolari e BiotecnologieDipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino) | Jublot , Delphine (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Poulain , Julie (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Bruyère , Clemence (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Billault , Alain (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Segurens , Béatrice (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Gouyvenoux , Michel (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Ugarte , Edgardo (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Cattonaro , Federica (Istituto di Genomica Applicata, UDINE(Italie).) | Anthouard , Véronique (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Vico , Virginie (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Del Fabbro , Gabriele (Istituto di Genomica ApplicataUniversità degli Studi di Udine, UDINEUDINE(Italie). Dipartimento di Matematica ed Informatica) | Alaux , Michael (INRA (France). UR 1164 Unité de Recherche Génomique Info) | Di Gaspert , Gabrielle (Istituto di Genomica ApplicataUniversità degli Studi di Udine, UDINEUDINE(Italie). Dipartimento di Scienze Agrarie ed Ambientali) | Dumas , Vincent (INRA (France). UMR 1131 Santé de la Vigne et Qualité du Vin) | Felice , Nicoletta (Istituto di Genomica ApplicataUniversità degli Studi di Udine, UDINEUDINE(Italie). Dipartimento di Scienze Agrarie ed Ambientali) | Paillard , Sophie (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Juman , Irena (Istituto di Genomica ApplicataUniversità degli Studi di Udine, UDINEUDINE(Italie). Dipartimento di Scienze Agrarie ed Ambientali) | Moroldo , Marco (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Scalabrin , Simone (Istituto di Genomica ApplicataUniversità degli Studi di Udine, UDINEUDINE(Italie). Dipartimento di Matematica ed Informatica) | Canaguier , Aurelie (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Le Clainche , Isabelle (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Malacrida , Giorgio (Università degli Studi di PadovaUniversità degli Studi di Verona, PADOVAFLORIANO(Italie). CRIBIDipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino) | Durand , Eleonore (INRA (France). UR 1164 Unité de Recherche Génomique Info) | Pesole , Graziano (Università degli Studi di BariConsiglio Nazionale delle RicercheUniversità degli Studi di Verona, BARIBARIFLORIANO(Italie). Dipartimento di Biochimica e Biologia MolecolareIstituto Tecnologie BiomedicheDipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino) | Laucou , Valerie (INRA (France). UMR 1097 Diversité et Adaptation des Plantes Cultivées) | Chatelet , Philippe (INRA (France). UMR 1098 Développement et Amélioration des Plantes) | Merdinoglu , Didier (INRA (France). UMR 1131 Santé de la Vigne et Qualité du Vin) | Delledonne , Massimo (Università degli Studi di VeronaUniversità degli Studi di Verona, FLORIANOFLORIANO(Italie). Dipartimento Scientifico e TecnologicoDipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino) | Pezzotti , Mario (Università degli Studi di VeronaUniversità degli Studi di Siena, FLORIANOSIENA(Italie). Dipartimento di Scienze , Tecnologie e Mercati della Vite e del VinoVIGNA-CRA Initiative, Consorzio Interuniversitario Nazionale per la Biologia Molecolare delle Piante) | Lecharny , Alain (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Scarpelli , Claude (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Artiguenave , François (Génoscope-Centre National de Séquençage, EVRY(France).) | Pè , M. Enrico (Università degli Studi di MilanoUniversità degli Studi di Verona, MILANOFLORIANO(Italie). Dipartimento di Scienze Biomolecolari e BiotecnogieDipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino) | Valle , Giorgio (Università degli Studi di PadovaUniversità degli Studi di Verona, PADOVAFLORIANO(Italie). CRIBIDipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino) | Morgante , Michele (Istituto di Genomica ApplicataUniversità degli Studi di Udine, UDINEUDINE(Italie). Dipartimento di Scienze Agrarie ed Ambientali) | Caboche , Michel (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Adam-Blondon , Anne-Francoise (INRA (France). UMR 1165 Génomique Végétale) | Weissenbach , Jean (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Quétier , Francis (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).) | Wincker , Patrick (Génoscope-Centre National de Séquençage(France).)
The analysis of the first plant genomes provided unexpected evidence for genome duplication events in species that had previously been considered as true diploids on the basis of their genetics1–3. These polyploidization events may have had important consequences in plant evolution, in particular for species radiation and adaptation and for themodulation of functional capacities4–10. Here we report a high-quality draft of the genome sequence of grapevine (Vitis vinifera) obtained from a highly homozygous genotype. The draft sequence of the grapevine genome is the fourth one produced so far for flowering plants, the second for a woody species and the first for a fruit crop (cultivated for both fruit and beverage). Grapevine was selected because of its important place in the cultural heritage of humanity beginning during the Neolithic period11. Several large expansions of gene families with roles in aromatic features are observed. The grapevine genome has not undergone recent genome duplication, thus enabling the discovery of ancestral traits and features of the genetic organization of flowering plants. This analysis reveals the contribution of three ancestral genomes to the grapevine haploid content. This ancestral arrangement is common to many dicotyledonous plants but is absent fromthe genome of rice, which is a monocotyledon. Furthermore, we explain the chronology of previously described whole-genome duplication events in the evolution of flowering plants.
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Cette notice bibliographique a été fournie par Institut national de la recherche agronomique
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