Atol : une ontologie dédiée aux traits des animaux d'élevage, un exemple sur le thème de la croissance et de la qualité de la viande
2012
Bugeon , Jérôme (INRA , Rennes (France). UR 1037 Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons ) | Baeza , Elisabeth (INRA , Nouzilly (France). UR 0083 Recherches Avicoles) | Brun , Jean-Paul (INRA , Saint-Genes-Champanelle (France). UMR 1213 Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores) | Cassar-Malek , Isabelle (INRA , Saint-Genes-Champanelle (France). UMR 1213 Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores) | Chatonnet , Arnaud (INRA , Montpellier (France). UMR 0866 Dynamique Musculaire et Métabolisme ) | Duclos , Michel (INRA , Nouzilly (France). UR 0083 Recherches Avicoles) | Fernandez , Xavier (INRA , Auzeville (France). UMR 1289 Tissus Animaux, Nutrition, Digestion, Ecosystème et Métabolisme) | Gondret , Florence (INRA , Saint Gilles (France). UMR 1348 Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage ) | Hue , Isabelle (INRA , Jouy-En-Josas (France). UMR 1198 Biologie du Développement et Reproduction) | Jurie , Catherine (INRA , Saint-Genes-Champanelle (France). UMR 1213 Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores) | Leibovitch , Serge (INRA , Montpellier (France). UMR 0866 Dynamique Musculaire et Métabolisme ) | Picard , Brigitte (INRA , Saint-Genes-Champanelle (France). UMR 1213 Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores) | Prache , Sophie (INRA , Saint-Genes-Champanelle (France). UMR 1213 Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores) | Rescan , Pierre-Yves (INRA , Rennes (France). UR 1037 Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons ) | Le Bail , Pierre-Yves (INRA , Rennes (France). UR 1037 Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons )
Recent technological advances in biology allow the collection of large sets of data which permit a precise description of the phenotypes. To process those data, computers require a standardized language to which the users (zootechnician, geneticists, physiologists, biochemists, ethologists, producers…) will be able to refer. The construction of this language is based on ontologies. INRA in collaboration with USDA in the USA have set up a program called ATOL (for “Animal Trait Ontology for Livestock”) aiming to define and organize the phenotypical characters of livestock species. Integrating societal concerns, the objective is to describe the traits underlying livestock production efficiency: welfare and adaptation, nutrition and feed efficiency, fertility and reproductive efficiency, mammary gland and milk production, growth and meat production. At present, 229 traits concern growth and meat production, of 6 major species (cattle, pig, chicken, trout, rabbit, sheep) with a good genericity.
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Informations bibliographiques
Cette notice bibliographique a été fournie par Institut national de la recherche agronomique
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