Distribution of Bg-homologous sequences in Gramineae species
1998
Hartings, H. | Lazzaroni, N. | Motto, M. | Frizzi, A. (Istituto Sperimentale per la Cerealicoltura, Rome (Italy))
anglais. The presence of sequence homologous to the Bg-transposable element from maize (Zea mays L.) was assessed in 29 accessions representing 15 Gramineae species. A PCR based analysis was employed to confirm the occurrence of Bg-homologous sequences in the genome of the accessions considered. Fourteen oligonucleotides covering 80% of the element's sequence were used to amplify Bgt-specific fragments. Homologous fragments could be amplified from all taxa analyzed. Sequence analyses were performed to establish the degree of homology between amplification products and the published sequence of the Bg element. Homology ranged from 39% for a fragment of Triticum aestivum to 75% for an amplification product derived from Avena sativa. Finally, Southern analyses performed with purified amplification products as molecular probes demonstrated that PCR products correspond to moderately repeated sequences, as expected for transposable elements
Afficher plus [+] Moins [-]italien. [In 29 accessioni rappresentative di 15 specie appartenenti alla famiglia delle Gramineae e' stata accertata la presenza dell'omologo sequenziale all'elemento trasponibile Bg del mais (Zea mays L.). Per confermare la presenza di sequenze omologhe BG nelle accessioni considerate, e' stata impiegata una analisi basata sulla PCR. Per amplificare i frammenti specifici Bg sono stati utilizzati quattordici oligonucleotidi che coprivano l'80% della sequenza dell'elemento. E' stato possibile amplificare i frammenti omologhi per tutti i taxa analizzati. Le analisi di sequenza sono state condotte per stabilire il grado di omologia fra i prodotti di amplificazione e la sequenza pubblicata dell'elemento Bg. L'omologia variava dal 39% per un frammento di Triticum aestivum al 75% per un prodotto di amplificazione derivato da Avena sativa. Infine, le analisi Southern, effettuate con prodotti di amplificazione purificati come sonde molecolari, ha dimostrato che i prodotti della PCR corrispondono a sequenze ripetute moderatamente, come era da attendersi per elementi trasponibili]
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Cette notice bibliographique a été fournie par Istituto di Servizi per il Mercato Agricolo Alimentare
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