Comparison of Cherry green ring mottle virus strains using RT-PCR and coat protein sequence phylogeny [Prunus]
2000
Zhang, Y.P. | Kirkpatrick, .C. (California Univ., Davis (USA). Dept. of Plant Pathology) | Uyemoto, J.K. (California Univ., Davis (USA)) | Di Terlizzi, B. (Istituto Agronomico Mediterraneo, Valenzano, Bari (Italy))
anglais. Assays for Cherry green ring mottle virus (CGRMV) were developed and used to compare different sources from North American and Mediterranean Countries by differential reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) amplification and phylogenetic analysis of coat protein sequences. DsRNAs of approximately 8.5 kbp in size were purified from all diseased samples. Universal and specific primer pairs derived from sequences of two Californian strains of CGRMV were used in RT-PCR assays. Parsimony analyses using coat protein nucleotide sequences separated the 12 CGRMV sources into three major phylogenetic clades
Afficher plus [+] Moins [-]italien. [Metodi di saggio per il virus della screziatura verde ad anello del ciliegio (CGRMV) sono stati sviluppati e utilizzati per confrontare fonti diverse provenienti dall'America Settentrionale e dai Paesi Mediterranei mediante amplificazione della reazione a catena della polimerasi a trascrizione inversa differenziale (RT-PCR) e analisi filogenetica delle sequenze della proteina capsidica. Da tutti i campioni affetti dalla malattia sono stati purificati DsDNA delle dimensioni approssimative di 8,5 kbp. Nei saggi RT-PCR sono state utilizzate paia di primer universali e specifici derivati dalle sequenze di due ceppi californiani di CGRMV. Le analisi basate sulle sequenze nucleotidiche delle proteine capsidiche hanno permesso di separare le 12 fonti di CGRMV in tre principali raggruppamenti filogenetici]
Afficher plus [+] Moins [-]Mots clés AGROVOC
Informations bibliographiques
Cette notice bibliographique a été fournie par Istituto di Servizi per il Mercato Agricolo Alimentare
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