Etat actuel du séquençage et de la connaissance du génome des espèces animales

Since the first publication of the human genome in 2001, many animal species of agronomic interest have been sequenced or are beingsequenced. After the production of genome assemblies by the Sanger* method with capillary sequencers, the new generation ofparallel sequencing machines (NGS : Next Generation Sequencing), now allows the rapid production of assemblies for a muchlarger number of species at low cost. An overview of the diverse principles of sequence production and assembly, highlighting theiradvantages and limits, is followed by a description of the state of progress of the knowledge in animal species of agronomic importance.Finally, a few examples of application areas of genome assemblies are described.

Depuis la première publication du génome humain en 2001, les génomes de nombreuses espèces animales d’intérêt agronomique ont été séquencés ou sont en cours de séquençage. Après la réalisation de l’assemblage des génomes pour les espèces majeures par la méthode de Sanger* et des séquenceurs capillaires, la nouvelle génération de séquenceurs parallèles (NGS : Next GenerationSequencing) permet maintenant le séquençage rapide et à bas coût d’un nombre bien plus grand d’espèces. Un rappel sur les divers principes du séquençage et de l’assemblage des génomes, permettant de mieux comprendre leurs avantages et leurs limites, est suivi d’une description de l’état d’avancement de la connaissance des génomes des animaux d’intérêt agronomique. Finalement, quelques exemples de domaines d’utilisation des génomes assemblés sont rapidement décrits.