L’adaptation des virus de plantes aux résistances variétales

Genetic resistances have allowed a large reduction of the impact of viral diseases in cultived plants. Their introduction into breeding programs was facilitated by the simple genetic control of many of them. However, as for any host-parasite couple, the targeted viruses can adapt rapidly to resistances even though the durability of resistances, i.e. the amount of time during which they remain efficient in crops, is highly variable. During these last two decades, the use of genetic analysis methods in plant viruses revealed the molecular mechanisms responsible for these adaptations and, hopefully, will allow a more precise prediction of the potential durability of resistances. If the mechanisms involved in virus adaptation at the plant scale have been unravelled, those responsible for the emergence of adapted viral populations at the agroecosystem scale are largely unknown. A better knowledge of the fitness of viral genotypes, adapted or not to the resistance, to infect their different host plants and to spread in the agro-ecosystem is needed. The difficulties linked to their experimental analysis require the development of mathematical modelling approaches of these phenomena, notably to define optimal spatiotemporal strategies of cultivar deployment.

Les résistances génétiques ont permis de réduire fortement l’impact des maladies virales chez de nombreuses plantes cultivées. Leur introduction dans les variétés commerciales a été facilitée par le contrôle génétique simple de beaucoup d’entre elles. Cependant, comme pour tout couple hôte-parasite, les virus s’adaptent à ces résistances, même si la durabilité de ces dernières, c’est-à-dire le temps pendant lequel elles demeurent efficaces en condition de culture, est très variable. Durant les deux dernières décennies, l’application des méthodes d’analyse génétique aux virus de plantes a permis de révéler les mécanismes moléculaires à l’origine de ces adaptations et laisse espérer des avancées prochaines dans la prédiction de la durabilité des résistances. Si, à l’échelle de la plante, les mécanismes générant les variants viraux adaptés sont désormais identifiés, les mécanismes impliqués dans l’émergence de populations virales contournant ces résistances à l’échelle de l’agroécosystème restent largement méconnus. Une meilleure compréhension de la valeur compétitive des génotypes viraux, adaptés ou non aux résistances, pour l’infection de leurs plantes hôtes et leur capacité de dissémination dans l’agroécosystème est ainsi nécessaire. Les difficultés de l’analyse expérimentale de ces phénomènes imposent le recours à la modélisation mathématique pour définir par exemple des stratégies spatiotemporelles optimales de déploiement des variétés cultivées.