Identification of the allelic state of the Rca2 gene for resistance to anthracnose and determination of genetic relatedness in garden strawberry genotypes | Идентификация аллельного состояния гена Rca2 устойчивости к антракнозу и определение генетического сходства у генотипов земляники садовой

anglais. The research addressed analysis the relationship of garden strawberry hybrids and varieties resistant and susceptible to anthracnose and determining the presumable allelic status of the resistance gene to Rca2 anthracnose was carried out in 2022–2023. ISSR primers were selected to identify polymorphism and build dendrites of genetic similarity of 19 genotypes from the collection of the Federal Scientific Breeding and Technology Center for Horticulture and Nursery. The efficiency of ISSR primers was assessed by the ISSR-PCR method, followed by gel electrophoresis of ISSR-PCR products in agarose gel. The STS-Rca2_240 SCAR marker was used to evaluate the allelic state of the Rca2 gene. The genetic distance of the analyzed strawberry samples was determined using the Jaccard coefficient. A cluster analysis was carried out using the STATISTICA (StatSoft) program. The assumed allelic status of the resistance gene to Rca2 anthracnose was established in the studied varieties and hybrids. A diagnostic fragment of the STS-Rca2_240 marker having a size of 240 bp was found in the 'Alpha' variety. By using a coefficient array for genetic similarity, dendrograms were built, whose analysis revealed the relationship between the studied varieties. Promising forms with a high degree of genetic similarity to anthracnose-resistant varieties and forms closely related to susceptible varieties were identified.

russe. Исследования проводились в 2022-2023 гг. Цель работы – анализ родства гибридов и сортов земляники садовой, устойчивых и восприимчивых к антракнозу, и определение предполагаемого аллельного статуса гена устойчивости к антракнозу Rca2. Выполнен подбор ISSR-праймеров для выявления полиморфизма и построения дендритов генетического сходства 19 генотипов из коллекции Федерального научного селекционно-технологического центра садоводства и питомниководства. Оценка эффективности ISSR-праймеров проводилась методом ISSR-PCR с последующим гель-электрофорезом продуктов ISSR-PCR в агарозном геле. Для оценки аллельного состояния гена Rca2 использовался SCAR-маркер STS-Rca2_240. Генетическая дистанция анализируемых образцов земляники садовой была определена с применением коэффициента Жаккара. Кластерный анализ проведен с использованием программы STATISTICA (StatSoft). У исследуемых сортов и гибридов установлен предполагаемый аллельный статус гена устойчивости к антракнозу Rca2. Диагностический фрагмент маркера STS-Rca2_240 размером 240 п.н. обнаружен у сорта Альфа. На основе массива коэффициентов генетического сходства были построены дендрограммы, в ходе их анализа установлено родство исследуемых сортообразцов. Выделены перспективные формы, обладающие высокой степенью генетического сходства с сортами, устойчивыми к антракнозу и формы, близкородственные восприимчивым сортам.