Three Infectious Viral Species Lying in Wait in the Banana Genome
2013
Chabannes, Matthieu | Baurens, Franc-Christophe | Duroy, Pierre-Olivier | Bocs, Stéphanie | Vernerey, Stéphanie | Rodier-Goud, Marguerite | Barbe, Valérie | Gayral, Philippe | Iskra-Caruana, Marie-Line | Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad) | Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro) | Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite (UMR BGPI) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro) | Génomique métabolique (UMR 8030) ; Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Institut de recherche sur la biologie de l'insecte (IRBI) ; Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
National audience
Afficher plus [+] Moins [-]anglais. Plant pararetroviruses integrate serendipitously into their host genomes. The banana genome harbors integrated copies of bananastreak virus (BSV) named endogenous BSV (eBSV) that are able to release infectious pararetrovirus. In this investigation,we characterized integrants of three BSV species—Goldfinger (eBSGFV), Imove (eBSImV), and Obino l’Ewai (eBSOLV)—in theseedy Musa balbisiana Pisang klutuk wulung (PKW) by studying their molecular structure, genomic organization, genomiclandscape, and infectious capacity. All eBSVs exhibit extensive viral genome duplications and rearrangements. eBSV segregationanalysis on an F1 population of PKW combined with fluorescent in situ hybridization analysis showed that eBSImV, eBSOLV,and eBSGFV are each present at a single locus. eBSOLV and eBSGFV contain two distinct alleles, whereas eBSImV has two structurallyidentical alleles. Genotyping of both eBSV and viral particles expressed in the progeny demonstrated that only one allelefor each species is infectious. The infectious allele of eBSImV could not be identified since the two alleles are identical. Finally, wedemonstrate that eBSGFV and eBSOLV are located on chromosome 1 and eBSImV is located on chromosome 2 of the referenceMusa genome published recently. The structure and evolution of eBSVs suggest sequential integration into the plant genome,and haplotype divergence analysis confirms that the three loci display differential evolution. Based on our data, we propose amodel for BSV integration and eBSV evolution in the Musa balbisiana genome. The mutual benefits of this unique host-pathogenassociation are also discussed.
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Cette notice bibliographique a été fournie par Institut national de la recherche agronomique
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