Fortune telling: metabolic markers of plant performance
2016
Fernandez, Olivier | Urrutia, Maria | Bernillon, Stéphane | Giauffret, Catherine | Tardieu, Francois, F. | Le Gouis, Jacques | Langlade, Nicolas | Charcosset, Alain, A. | Moing, Annick | Gibon, Yves, Y. | Biologie du fruit et pathologie (BFP) ; Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB) | Agroressources et Impacts environnementaux (AgroImpact) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) | Écophysiologie des Plantes sous Stress environnementaux (LEPSE) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro) | Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP) | Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Plateforme Métabolome Bordeaux; SUNRISE (ANR-11-BTBR-0005) ; AMAIZING (ANR-10-BTBR-0001); REEDWHEAT (ANR-10-BTBR-0003); MetaboHUB (ANR-11-INBS-0010); PHENOME (ANR-11-INBS-0012) | ANR-11-BTBR-0005,SUNRISE,Ressources génétiques de tournesol pour l'amélioration de la stabilité de production d'huile sous c(2011) | ANR-10-BTBR-0001,AMAIZING,Développer de nouvelles variétés de maïs pour une agriculture durable: une approche intégrée de la génomique à la sélection(2010) | ANR-10-BTBR-0003,BREEDWHEAT,Développer de nouvelles variétés de blé pour une agriculture durable(2010) | ANR-11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation(2011) | ANR-11-INBS-0012,PHENOME,Centre français de phénomique végétale(2011) | European Project: 244374,EC:FP7:KBBE,FP7-KBBE-2009-3,DROPS(2010)
International audience
Afficher plus [+] Moins [-]anglais. Background: In the last decade, metabolomics has emerged as a powerful diagnostic and predictive tool in many branches of science. Researchers in microbes, animal, food, medical and plant science have generated a large number of targeted or non-targeted metabolic profiles by using a vast array of analytical methods (GC–MS, LC–MS, 1H-NMR….). Comprehensive analysis of such profiles using adapted statistical methods and modeling has opened up the possibility of using single or combinations of metabolites as markers. Metabolic markers have been proposed as proxy, diagnostic or predictors of key traits in a range of model species and accurate predictions of disease outbreak frequency, developmental stages, food sensory evaluation and crop yield have been obtained. Aim of review : (i) To provide a definition of plant performance and metabolic markers, (ii) to highlight recent key applications involving metabolic markers as tools for monitoring or predicting plant performance, and (iii) to propose a workable and cost-efficient pipeline to generate and use metabolic markers with a special focus on plant breeding. Key message: Using examples in other models and domains, the review proposes that metabolic markers are tending to complement and possibly replace traditional molecular markers in plant science as efficient estimators of performance.
Afficher plus [+] Moins [-]Mots clés AGROVOC
Informations bibliographiques
Cette notice bibliographique a été fournie par Institut national de la recherche agronomique
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