Méthodes d’analyses de la matière organique ; méthodes biochimiques, méthodes d’analyse des pigments chlorophylliens et analyse thermique élémentaire

The study aims to update and specify the analytical methods commonly used at URAPC/IFREMER laboratory in La Tremblade. The first part of this study focused on the various types of variability by using biochemical methods to assess oyster meat proteins, lipids and carbohydrates concentrations. Moreover, proximate biochemical composition of oyster meat was compared among individuals and within groups (homogeneized pooled meat). Results showed that conclusions were affected by the way samples were prepared (individuals or pooled samples). The carbohydrates concentration among oysters showed the highest variability. The second part of the study focused on chlorophyll a and pheophytin analysis. Several chlorophyll a origins were compared using Turner and Jenway fluorimeters. Several extinction filters commonly used affected significantly the estimates, therefore prompting to revalue fluorimeters calibrating procedures. Comparison between three origins of organic matter (i.e., oyster meat, suspended particulate organic matter, sediment particulate matter) were carried out by using two types of analytical methods: chemical analysis and combustion analysis using a CHN/SO analyser. Although results showed correlated estimates between the two methods for oyster meat, no relationship was established between both lipids estimates from the suspended organic matter or from sediment. The uncorrelated estimates resulted from the lipids’extraction method which should be reviewed for this sample types.

Ce travail trouve son origine dans la volonté de mettre à jour et de préciser les méthodes analytiques mises en oeuvre au laboratoire URAPC de la Tremblade. Une première partie est une réflexion sur les différents types de variabilité des résultats d’analyses biochimiques des protéines, lipides et glucides de la chair d’huître (Crassostrea gigas), et sur la signification des résultats dans le cas d’analyses globales de plusieurs individus (mélange des chairs), ou dans le cas de mesures individuelles, huître par huître. Selon le cas, l’interprétation zootechnique des résultats d’affinage en claire est différente!... La teneur en glucides inter-huîtres présente la plus grande variabilité. La deuxième partie de ce rapport est consacrée à l’analyse de la chlorophylle a et des phéopigments. Les résultats comparatifs d’analyses effectuées sur plusieurs sources de chlorophylle à partir de deux types de fluorimètres (Turner et Jenway), conduit à remettre en cause l’utilisation de certains filtres à fort pouvoir absorbant, et à préciser les conditions d’étalonnage des appareils. Dans la troisième partie de l’étude, les analyses biochimiques effectuées sur 3 sources différentes de matière organique (chair, matière organique en suspension et vase) sont comparées aux résultats obtenus par un analyseur thermique des éléments constituants de la matière (CHN). Si les résultats sont cohérents entre les deux méthodes d’analyse pour les mesures de chair, un problème apparaît au niveau de l’analyse des lipides sur la matière organique en suspension dans l’eau, ainsi que sur celle contenue dans la vase. La méthode d’extraction des lipides dans ces deux derniers cas, est suspectée et doit être remise en cause.