The cyst-dividing bacterium Ramlibacter tataouinensis TTB310 genome reveals a well-stocked toolbox for adaptation to a desert environment.
2011
de Luca, Gilles | Barakat, mohamed | Ortet, Philippe | Fochesato, Sylvain | Jourlin-Castelli, Cécile | Ansaldi, Mireille | Py, Béatrice | Fichant, Gwennaele | Coutinho, Pedro, M | Voulhoux, Romé | Bastien, Olivier | Maréchal, Eric | Henrissat, Bernard | Quentin, Yves | Noirot, Philippe | Filloux, Alain | Méjean, Vincent | Dubow, Michael S | Barras, Frédéric | Barbe, Valérie | Weissenbach, Jean | Mihalcescu, Irina | Verméglio, André | Achouak, Wafa | Heulin, Thierry | Laboratoire d'Ecologie Microbienne de la Rhizosphère et d'Environnements Extrêmes (LEMIRE) ; Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) (BIAM) ; Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | Biologie végétale et microbiologie environnementale - UMR7265 (BVME) ; Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) (BIAM) ; Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | Laboratoire de chimie bactérienne (LCB) ; Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires - UMR5100 (LMGM) ; Centre de Biologie Intégrative (CBI) ; Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Architecture et fonction des macromolécules biologiques (AFMB) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Laboratoire d'ingénierie des systèmes macromoléculaires (LISM) ; Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Laboratoire de physiologie cellulaire végétale (LPCV) ; Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG) ; Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech | Institut de génétique et microbiologie [Orsay] (IGM) ; Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Institut de Génomique d'Evry (IG) ; Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB) ; Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | Laboratoire Interdisciplinaire de Physique [Saint Martin d’Hères] (LIPhy) ; Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Commissariat a l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA); Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Ministry of Higher Education and Research
International audience
Afficher plus [+] Moins [-]anglais. Ramlibacter tataouinensis TTB310(T) (strain TTB310), a betaproteobacterium isolated from a semi-arid region of South Tunisia (Tataouine), is characterized by the presence of both spherical and rod-shaped cells in pure culture. Cell division of strain TTB310 occurs by the binary fission of spherical "cyst-like" cells ("cyst-cyst" division). The rod-shaped cells formed at the periphery of a colony (consisting mainly of cysts) are highly motile and colonize a new environment, where they form a new colony by reversion to cyst-like cells. This unique cell cycle of strain TTB310, with desiccation tolerant cyst-like cells capable of division and desiccation sensitive motile rods capable of dissemination, appears to be a novel adaptation for life in a hot and dry desert environment. In order to gain insights into strain TTB310's underlying genetic repertoire and possible mechanisms responsible for its unusual lifestyle, the genome of strain TTB310 was completely sequenced and subsequently annotated. The complete genome consists of a single circular chromosome of 4,070,194 bp with an average G+C content of 70.0%, the highest among the Betaproteobacteria sequenced to date, with total of 3,899 predicted coding sequences covering 92% of the genome. We found that strain TTB310 has developed a highly complex network of two-component systems, which may utilize responses to light and perhaps a rudimentary circadian hourglass to anticipate water availability at the dew time in the middle/end of the desert winter nights and thus direct the growth window to cyclic water availability times. Other interesting features of the strain TTB310 genome that appear to be important for desiccation tolerance, including intermediary metabolism compounds such as trehalose or polyhydroxyalkanoate, and signal transduction pathways, are presented and discussed.
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Informations bibliographiques
Cette notice bibliographique a été fournie par Institut national de la recherche agronomique
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