Tools to identify, trace and mitigate Bacillus thuringiensis contaminations from field to fork | BtID -Outils pour identifier, tracer et contrôler les contaminants de Bacillus thuringiensis de la fourche à la fourchette

International audience

anglais. Bacillus thuringiensis or Bt is an ubiquitous bacteria used in agriculture for crop protection exploiting its insecticidal properties since the 1950s. At a taxonomic level, Bt belongs to the Bacillus cereus group (sensu lato) which also contains strains that may be involved in food quality and safety. While the use of commercial phytosanitary products based on Bt strains is an effective, easy-to-use and low cost treatment for crop protection, the persistence of spores on treated vegetables is not always compatible with food microbiological criteria. The BtID project carried out (1) experimental characterizations on the diversity of B. thuringiensis and the positioning of commercial strains within the B. cereus Group; (2) a review of agricultural practices for the protection of Bt-based plants as well as (3) the development of methodologies and decision-making tools to identify, distinguish and trace the Bt strains authorized at the European level, from field to fork. This collection of commercial strains made it possible to sequence the genome of three distinct strains, which represent the majority of strains used in Bt biopesticides, and to achieve a detailed characterization of the behavior of these highly specialized strains, as well as their occurrence on raw materials (vegetables) and processed food.

français. Bacillus thuringiensis ou Bt est une bactérie ubiquiste utilisée dans le domaine agricole en protection des cultures pour ses propriétés insecticides depuis les années 1950. Au niveau taxonomique, Bt appartient au groupe Bacillus cereus (sensu lato), qui contient également des souches pouvant être impliquées dans la qualité et sécurité des aliments. Même si l’utilisation de produits phytosanitaires à base de souches commerciales de Bt est un moyen efficace, facile d’utilisation et avantageux pour la protection des cultures, la persistance de spores sur les végétaux traités n’est pas toujours compatible avec les critères microbiologiques fixés pour leur utilisation dans les denrées alimentaires. Le projet BtID a permis (1) d’évaluer la diversité de B. thuringiensis et le positionnement de souches commerciales au sein du groupe B. cereus ; (2) de passer en revue les pratiques agricoles pour la protection des plantes à base de Bt ainsi que (3) de développer des méthodologies et outils d’aide à la décision permettant d’identifier, distinguer et tracer les souches de Bt autorisées au niveau européen, du champ à l’assiette. La collecte de ces souches commerciales a permis le séquençage du génome de trois représentants distincts majoritaires utilisés en biocontrôle, une caractérisation fine du comportement de ces souches hautement spécialisées, ainsi que d’étudier leur prévalence au niveau des matières premières (légumes) et produits finis (alimentaires transformés).