Nuevos haplotipos de Diaphorina citri, vector de Candidatus Liberibacter en zonas citrícolas de México | New haplotypes of Diaphorina citri, vector of Candidatus Liberibacter in citrus areas of Mexico
2023
Ceballos Ceballos, Augusto Gil | Cerna Chavez, Ernesto | Ochoa Fuentes, Yisa María | Rodríguez Pagaza, Yolanda
Resumen Se identificaron nuevos haplotipos de Diaphorina citri también conocido como el psílido asiático de los cítricos, denominados DcitACC-1, DcitACC-2 y DcitACC-3. Los estudios se basaron en la amplificación de ADN del gen COI mitocondrial y se utilizaron individuos de diferentes zonas citrícolas del país, en algunas zonas productoras del país no se han realizado muestreos con anterioridad, específicamente en los municipios de Acatlán de Pérez, Oaxaca, Misantla y Tantoyuca, Veracruz y Huejutla, Hidalgo, por lo que se procedió a colectar insectos adultos sin distinción de género. El número de individuos de cada sitio colectado dependió de la disponibilidad de insectos en el lugar. Se obtuvieron en total 60 individuos colectados. La amplificación del ADN se realizó con los iniciadores específicos DCITRI COI-L y DCITRI COI-R, el producto de la reacción PCR se secuenció en el Instituto Potosino de Investigación Científica y Tecnológica, AC (IPICYT). Las secuencias obtenidas se compararon con las reportadas en el Genebank y se determinó que existe una línea matriz que corresponde a los haplotipos Dcit-01 y Dcit-04 con número de identificación FJ190300 y FJ190306 (Boykin, 2007). Se obtuvieron 22 secuencias que se analizaron con los programas Oligo analizer y Clustal Omega y se identificaron 11 secuencias iguales a los haplotipos Dcit-01 y Dcit-04. Los resultados mostraron 13 secuencias con diferencias en tres nucleótidos específicos: 61, 253 y 636, mismos que son reportados en este trabajo como nuevos haplotipos.
Afficher plus [+] Moins [-]Abstract New haplotypes of Diaphorina citri, also known as the Asian citrus psyllid, were identified, called DcitACC-1, DcitACC-2, and DcitACC-3. The studies were based on the amplification of DNA of the mitochondrial COI gene and individuals from different citrus areas of the country were used, in some producing areas of the country no samplings have been carried out before, specifically in the municipalities of Acatlán de Pérez, Oaxaca, Misantla and Tantoyuca, Veracruz, and Huejutla, Hidalgo , so adult insects were collected without distinction of gender. The number of individuals collected from each site depended on the availability of insects at the site. A total of 60 individuals were collected. DNA amplification was performed with the specific primers DCITRI COI-L and DCITRI COI-R, the product of the PCR reaction was sequenced at the Institute for Scientific and Technological Research of San Luis Potosí (IPICYT, for its acronym in Spanish). The sequences obtained were compared with those reported in Genbank and it was determined that there is a matrix line corresponding to haplotypes Dcit-01 and Dcit-04 with identification numbers FJ190300 and FJ190 306 (Boykin, 2007). Twenty-two sequences were obtained, which were analyzed with the Oligo analyzer and Clustal Omega programs and 11 sequences equal to haplotypes Dcit-01 and Dcit-04 were identified. The results showed 13 sequences with differences in three specific nucleotides: 61, 253 and 636, which are reported in this work as new haplotypes.
Afficher plus [+] Moins [-]Mots clés AGROVOC
Informations bibliographiques
Cette notice bibliographique a été fournie par Scientific Electronic Library Online Mexico
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