AgroLD: a Knowledge Graph for the Plant Sciences
2023
Larmande, Pierre | Pitollat, Bertrand | Tando, Ndomassi | Pomie, Yann | Happi Happi, Bill Gates | Guignon, Valentin | Ruiz, Manuel | Diversité, adaptation, développement des plantes (UMR DIADE) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie])-Université de Montpellier (UM) | WEB Architecture x Semantic WEB x WEB of Data (LIRMM | WEB3) ; Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM) ; Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM) | Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM) | Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad) | The Alliance of Bioversity International and International Center for Tropical Agriculture (CIAT) [Hanoi] ; Alliance of Bioversity International and the International Center for Tropical Agriculture (CIAT) [Rome] (Alliance) ; Consultative Group on International Agricultural Research [CGIAR] (CGIAR)-Consultative Group on International Agricultural Research [CGIAR] (CGIAR)
Démonstration
Afficher plus [+] Moins [-]International audience
Afficher plus [+] Moins [-]anglais. Recent advances in high-throughput technologies have revolutionized the analysis in the field of the plant sciences. However, there is an urgent need to effectively integrate and assimilate complementary information to understand the biological system in its entirety. We have developed AgroLD, a knowledge graph that exploits Semantic Web technologies to integrate data of interest for the plant science community e.g., rice, wheat, arabidopsis and in this way facilitate the formulation and validation of new scientific hypotheses. AgroLD contains around 900M triples created by annotating and integrating more than 100 datasets coming from 15 data sources. Our objective is to offer a domain specific knowledge platform to answer complex biological and plant sciences questions related to the implication of genes in, for instance, plant disease resistance or adaptative responses to climate change. In this demo, we present some results which currently focused on genomics, genetics and trait associations.
Afficher plus [+] Moins [-]Mots clés AGROVOC
Informations bibliographiques
Cette notice bibliographique a été fournie par Institut national de la recherche agronomique
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