Tenacibaculum platacis sp. nov., Tenacibaculum vairaonense sp. nov. and Tenacibaculum polynesiense sp. nov. isolated from batfish (Platax orbicularis) in Tahiti Island, French Polynesia
2025
Lopez, Pierre | Fradet, Benjamin | Coffion, Lucie | Bernardet, Jean-François | Saulnier, Denis | Duchaud, Éric | Virologie et Immunologie Moléculaires (VIM (UR 0892)) ; Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Ecosystèmes Insulaires Océaniens (UMR 241) (EIO) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD) | Analyse Bio-Informatique pour la Génomique et le Métabolisme (LABGeM) ; Génomique métabolique (UMR 8030) ; Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Institut de Biologie François JACOB (JACOB) ; Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | IFREMER-DRM - Aqua-Sana2 | ANR-10-INBS-0009,France Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010) | ANR-11-INBS-0013,IFB (ex Renabi-IFB),Institut français de bioinformatique(2011)
[Éthique] Échantillonnages sur animaux
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Afficher plus [+] Moins [-]anglais. Ten novel Gram-negative, aerobic, non-sporulating, yellow-pigmented rod-shaped bacterial strains motile by gliding were isolated from marine organisms/environments in French Polynesia. Three of them designated as 190524A05c T , 190524A02b T and 190130A14a T were retrieved from orbicular batfish ( Platax orbicularis ) mucus. Online database comparisons using 16S rRNA amplicons resulted in over 95% similarity to the genus Tenacibaculum . Phylogenetic analyses based on 679 concatenated core protein sequences revealed that strains 190524A05c T , 190524A02b T and 190130A14a T showed the highest similarity to Tenacibaculum skagerrakense DSM 14836 T , Tenacibaculum xiamenense LMG 27422 T and Tenacibaculum holothuriorum S2-2 T , respectively. Digital DNA–DNA hybridization and average nt identity values between strains 190524A05c T , 190524A02b T and 190130A14a T and other type strains were less than 76.25 and 24.1%, respectively. The DNA G+C content was 31.48, 30.66 and 31.98 mol% for strains 190524A05c T , 190524A02b T and 190130A14a T , respectively. Menaquinone-6 was detected as the major isoprenoid quinone in these three strains. The major polar lipids (phosphatidylethanolamine and aminophospholipid) were similar to the chemotaxonomic profile of other species of the genus Tenacibaculum . Strain 190524A05c T contained summed feature 3 (comprising C 16:1 ω7c and/or iso-C 15:0 2-OH), iso-C 15:1 G, iso-C 15:0 and iso-C 17:0 3-OH as the major cellular fatty acids. Strain 190524A02b T contained summed feature 3 (comprising C 16:1 ω7c and/or iso-C 15:0 2-OH), iso-C 15:0 , iso-C 15:1 G and iso-C 17:0 3-OH as the major cellular fatty acids. Strain 190130A14a T contained iso-C 15:1 G, summed feature 3 (comprising C 16:1 ω7c and/or iso-C 15:0 2-OH), iso-C 15:0 and iso-C 17:0 3-OH as the major cellular fatty acids. Based on the phenotypic and molecular features, these three strains represent novel species of the genus Tenacibaculum for which the names Tenacibaculum platacis sp. nov., with 190524A05c T (= CIP 112470 T = DSM 118113 T ) as the type strain; Tenacibaculum vairaonense sp. nov., with 190524A02b T (= CIP 112469 T = DSM 118112 T ) as the type strain; and Tenacibaculum polynesiense sp. nov., with 190130A14a T (= CIP 112468 T = DSM 118111 T ) as the type strain, are proposed.
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Informations bibliographiques
Cette notice bibliographique a été fournie par Institut national de la recherche agronomique
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