Orthopoxviruses in European rodents | Orthopoxvirus i europeiska gnagare

Orthopoxviruses are a group of zoonotic pathogens that are able to infect a broad range of mammals, including many species of rodents. In European rodents, the most prevalent orthopoxvirus is the Cowpox virus, which is also known to be able to cause disease in humans. The aim of this study was to understand what viruses of the genus Orthopoxvirus are present in European rodents, as well as to see if there is a higher risk of transmission in urban areas with low biodiversity, versus rural areas with high biodiversity. For the study serological data from 2791 rodents, from Belgium, France, Germany and Finland, captured during spring and autumn 2020-2022 and autumn 2024, was analyzed in silico. The serological data revealed a higher total seropositivity in rodents captured in rural areas, with Myodes glareolus having the highest seropositivity in combination with a large sample size. To understand which Orthopoxviruses are circulating in the rodents, 222 tissue samples from Myodes glareolus were analyzed using conventional PCR targeting the hemagglutinin gene of Orthopoxviruses. The PCR analysis did not reveal any viral DNA in the tissues, due to either low or non-existent viremia during the time of sampling, or the use of the wrong tissue type. The results of the study show that there is a higher risk of transmission in rural areas compared to urban areas, but the exact viral species circulating is unclear.

Orthopoxvirus är en grupp av zoonotiska virus som är kapabla att infektera en bred grupp av däggdjur, inklusive ett flertal olika gnagare. I europeiska gnagare är Kokoppsviruset det mest prevalenta orthopoxviruset och viruset kan även orsaka sjukdom hos människor. Målet med denna studie var att få förståelse för vilka orthopoxvirus som finns hos europeiska gnagare samt att se ifall det finns en större risk för överföring i urbana områden med lägre biodiversitet, jämfört med rurala områden med högre biodiversitet. För studien analyserades serologiska data från 2791 gnagare, fångade i Frankrike, Tyskland, Belgien och Finland under våren och hösten 2020–2022 samt hösten 2024, in silico. Den serologiska datan visade en högre total seropositivitet hos gnagare fångade i rurala områden och att Myodes glareolus hade den högsta seropositiviteten i kombination med ett stort urval. För att få förståelse över vilka arter av Orthopoxvirus cirkulerar i gnagarna analyserades 222 vävnadsprover med hjälp av konventionell PCR där orthopoxvirusets hemagglutinin-gen fungerade som mål. PCR-analysen uppvisade inget viralt DNA i vävnaderna, vilket kan bero på endera låg eller icke-existerande viremi vid provtagningstidpunkten eller användningen av fel typ av vävnad. Resultaten av studien visar att det finns en högre risk för överföring i rurala områden jämfört med urbana områden, men den exakta arten av virus som cirkulerar i populationerna är fortfarande oklar.