Environnemental DNA: a methodological jump for biodiversity surveys | ADN « environnemental » : un saut méthodologique pour les inventaires de la biodiversité

anglais. Living organisms leave DNA fragments in their environment. Molecular biology tools allow amplifying specific DNA fragments. As a result it is possible to perform biodiversity surveys based on samples (water, soil, etc.) containing DNA fragments (called DNAe for environmental DNA) identified as belonging to a species. This method was used for the first time in France to carry out an inventory of the invasive American Bullfrog, Lithobates catesbeianus, as part of an eradication program. The results show a much higher efficiency of this new method to detect the species at sites where it is present at low densities. The DNAe method was also used in North America to detect Asian carps - which are invasive - in the Chicago canals. The method proved again to be very sensitive and more efficient than conventional methods (electrofishing). There are still methodological developments to be consolidated, but the potential of the DNAe method for biodiversity surveys and early detection of invasive species should be swiftly demonstrated in studies where it is currently used (e.g. aquatic mammals, crayfishes, amphibians, fishes).

français. Les organismes vivants laissent des fragments d'ADN dans leur environnement. Les outils de la biologie moléculaire permettent d'amplifier des fragments d'ADN spécifiques. Il en résulte qu'il est possible de proposer des inventaires de la biodiversité basée sur une collecte d'échantillons (eau, sols, etc.) contenant des fragments d'ADN (dit ADNe pour ADN environnemental) identifiés comme appartenant à une espèce. Cette méthode a été utilisée pour la première fois en France pour réaliser l'inventaire de la Grenouille taureau Lithobates catesbeianus dans le cadre d'un programme d'éradication de cette espèce envahissante. Les résultats montrent l'efficacité très supérieure de cette nouvelle méthode pour détecter l'espèce dans des sites où elle est présente à de faibles densités. La méthode ADNe a également été utilisée en Amérique du Nord pour détecter la présence des carpes asiatiques – envahissantes – dans les canaux de Chicago. La méthode s'est avérée là aussi très sensible et plus performante que les méthodes classiques (pêche électrique). Il reste des développements méthodologiques à consolider, mais le potentiel de la méthode de l'ADNe dans le domaine des inventaires de biodiversité et de la détection précoce des espèces envahissantes devrait être rapidement démontré dans les études où elle est actuellement utilisée (i.e. mammifères aquatiques, écrevisses, amphibiens, poissons).