Atlas of the Development of the Japanese Medaka (Oryzias latipes) – An In vivo and Histological Journey

[ES] El pez medaka japonés (Oryzias latipes), teleósteo ovíparo de agua dulce nativo del sudeste asiático, es un modelo ampliamente utilizado en investigación científica gracias a su pequeño tamaño, corto ciclo de vida, embriones transparentes y genoma bien caracterizado, lo que facilita estudios en genética, biología del desarrollo y toxicología ambiental. A pesar de su uso generalizado, no se dispone de un atlas tridimensional in vivo de su desarrollo embrionario, estando los recursos actuales limitados únicamente a dibujos esquemáticos. De manera similar, los atlas histológicos que describen el desarrollo post-eclosión hasta el adulto en el medaka son también muy escasos, lo que dificulta la comprensión de la diferenciación de los tejidos y la organogénesis más allá de las etapas embrionarias. Basándonos en el estado actual del conocimiento, este atlas presenta una visión integral del desarrollo del medaka mediante más de 3.000 imágenes, organizadas en dos secciones: imágenes in vivo del desarrollo embrionario y un estudio histológico del desarrollo post-eclosión hasta la maduración sexual. El atlas in vivo del desarrollo embrionario proporciona una herramienta práctica para investigadores, docentes y estudiantes, complementando los atlas disponibles mediante dibujos, y aclarando procesos que a menudo resultan complejos o subjetivos, mientras que el atlas histológico se extiende más allá de la embriogénesis, ofreciendo una documentación detallada de la anatomía microscópica y la maduración de los órganos a lo largo de las etapas post-eclosión. En conjunto, estos recursos favorecen una mejor comprensión de la fisiología normal y constituyen una referencia valiosa para la biología del desarrollo del medaka, la toxicología ambiental y la histopatología, proporcionando una base que facilite e inspire futuras investigaciones con el medaka. Este proyecto representa un hito, la culminación de más de 15 años de investigación colaborativa entre el Departamento de Biología Celular e Histología, Facultad de Medicina, Universidad Complutense, y el Laboratorio de Ecotoxicología, Departamento de Medio Ambiente y Agronomía, Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, ambos ubicados en Madrid, España.

[EN] The Japanese medaka fish (Oryzias latipes) is an egg-laying freshwater teleost native to South East Asia, widely used in scientific research due to its small size, short generation time, transparent embryos, and well-characterized genome, facilitating studies in genetics, developmental biology, and environmental toxicology. Despite its widespread use, a three-dimensional in vivo atlas of medaka embryonic development is lacking, with current resources limited to schematic drawings. Similarly, histological atlases describing medaka post-hatching development to adulthood are also very scarce, making it difficult to understand tissue differentiation and organogenesis beyond the embryonic stages. Building upon current knowledge, this atlas presents a comprehensive overview of medaka development through over 3,000 images, organized into two sections: in vivo imaging of embryonic development and histological examination of post-hatch development through sexual maturation The in vivo atlas of embryo development provides a practical tool for researchers, educators, and students, complementing existing staging systems and clarifying processes that are often complex or subjective, while the histological atlas extends beyond embryogenesis, offering detailed documentation of microscopic anatomy and organ maturation across post-hatch developmental stages. Together, these resources support a better understanding of normal physiology and provide a valuable reference for developmental biology, environmental toxicology, and histopathology, providing a foundation to facilitate and inspire future research with medaka. This project represents a milestone, the culmination of more than 15 years of collaborative research between the Department of Cell Biology and Histology, School of Medicine, Complutense University, and the Laboratory of Ecotoxicology, Department of the Environment and Agronomy, National Institute for Agricultural and Food Research and Technology, both located in Madrid, Spain.

Financiado de modo indirecto gracias a proyectos de investigación en curso a lo largo de los 16 años de desarrollo del trabajo y donde estaban incluidos estudios histológicos en el medaka: Funding agencies of the resource / Research project in which it is included Indirectly funded through ongoing research projects carried out over the 16 years of the development of this work, which included histological studies with the medaka: • RTI2018-096046-B-C21. Estrategia integrada para evaluar el impacto ecotoxicológico de nano/microplásticos como vehículos de contaminantes emergentes (retardadores de llama) en medios dulceacuícolas. Programa Estatal de I+D+i Orientada a los Retos de la Sociedad (2019-2022). IP: Miguel González-Doncel/María Victoria Pablos. • CTM2014-52388-R. Aguas Regeneradas en Agricultura. Transferencia de contaminantes Emergentes a Cultivos. Financiación: Programa Estatal de Investigación, Desarrollo e Innovación Orientada a los Retos de la Sociedad (2015-2018). IP: Carlos Fernández Torija. • CTM2010 19779-C02: Contaminantes emergentes: Consecuencias ambientales del uso de residuos como enmiendas agrícolas. Valoración ecotoxicológica y estudio de transferencia al medio. Programa Nacional I+D+i (2011-2013). IP: Gregoria Carbonell Martín • RTA2010-00004-C02-01: Reutilización agraria de efluentes de depuradora. Evaluación del riesgo ambiental de contaminantes emergentes en la cuenca del río Henares-Jarama-Tajo (REAGUA). Financiación: Programa Nacional de Recursos y Tecnologías Agroalimentarias (2010-2013). IP: Carlos Fernández Torija

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