Bu çalışmada, Mersin körfezinde avlanan mavi yengecin (Callinectes sapidus Rathbun, 1896) mikrobiyolojik kalite bakımdan incelenmesi amaçlanmıştır. Örnekler, Mersin Merkez (1. İstasyon), Erdemli (2. İstasyon) ve Silifke (3. İstasyon) ilçelerinde avlanan balıkçılardan temin edilmiş ve Mersin Gıda Kontrol Laboratuvar Müdürlüğü’nde analize alınmıştır. Çalışmada 180 adet örnek kullanılmış olup, analizler Ocak - Aralık 2014 tarihleri arasında aylık periyotlar şeklinde yapılmıştır. Araştırmada Salmonella spp., Koagulaz pozitif Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Listeria monocytogenes, Vibrio choleraee, Vibrio parahaemolyticus, ve koliform grubu bakteriler araştırılmıştır. Çalışmada elde edilen sonuçlar göre; Salmonella spp., Listeria monocytogenes, Vibrio parahaemolyticus ve Vibrio cholerae her üç istasyonda da yıl boyunca tespit edilmemiştir. Koagulaz pozitif Staphylococcus aureus, Escherichia coli ve koliform grubu bakteriler ise üç çalışma istasyonunda tespit edilmiş ve sıcaklığa bağlı olarak artış gösterdikleri saptanmıştır. Sonuç olarak; çevresel kökenli faktörlerin taze yakalanmış yengeçlerin bakteriyel florası üzerinde etkisinin olduğu sonucuna varılmıştır.