Se estudia la variabilidad temporal de las características hidrográficas y de las masas de agua de Bahía San Jorge, norte de Chile, en base a mediciones con CTD realizados en una transecta, formada por un máximo de 8 estaciones durante 8 cruceros realizados en días específicos del período 2008-2012. Se analizan las características del viento en los meses de estudio y en períodos de 5 días incluidas las fechas de muestreo. La hidrografía muestra un predominio de 3 masas de agua modificadas: Agua Superficial Subantártica (ASSA), Agua Superficial Subtropical (ASST) y Agua Ecuatorial Subsuperficial (AESS). La variación de los porcentajes de las masas de agua superficiales (ASSA y ASST) dependería fundamentalmente de las características de la dirección de la Corriente Costera de Chile la cual estaría modula por el viento favorable a la surgencia costera que a su vez sería responsable de los aportes de AESS a la superficie. Esta última masa de agua podría estar ingresando tanto por el sector norte como por el sur de la bahía, al provenir de los focos de surgencia de Punta Angamos y Punta Coloso (entre otros focos), respectivamente. Por otra parte, el predominio de AESS en la capa inferior de la bahía, estaría indicando el ingreso de la Corriente Ecuatorial Subsuperficial (CESS) desde el norte y su vaciamiento por el sur. A su vez, los altos porcentajes de esta masa de agua en invierno podrían deberse a efectos de mezcla vertical generados por un enfriamiento, de la capa superficial, típico de invierno. | Temporal variability of hydrographic characteristics and coastal water masses are study at San Jorge Bay, northern Chile, with a CTD. The measurements were made along a transect formed by 8 stations maximum, during 8 times at specific days of the 2008-2012 period. Wind characteristics were analyzed for the sample months and 5 day period, including the dates of measurements. The hydrography shows the predominance of 3 modified water masses inside the bay: Subantarctic Surface Water (SASW), Subtropical Surface Water (STSW), and Equatorial Subsurface Water (ESSW). The percentage variability of SASW and STSW depends on the direction of the Chile Coastal Current, which is also modulated by the coastal upwelling favorable wind. This mechanism is responsible of ESSW ascent. This water mass can be introduce to the bay from the north and south sides as it upwells at Punta Angamos and Punta Coloso centers respectively, besides other sites. The dominance of ESSW in the bay's lower layer indicates the entrance of the Subsurface Equatorial Current (SSEC) from the north side and its southern exit. The high percentage of this last water mass during austral winter could be explained by the vertical mixing generated by cooling of the surface layer.