Variability of peanut stripe virus strains at molecular level based on coat protein gene and 3'UTR (Untranslated region) of PStV genomic RNA

Английский. Variability of various peanut stripe virus (PStV) strains at the molecular level was studied based on nucleotide sequence of coat protein (CP) cistron and 3' UTR (untranslated region). Six PStV strains causing different types of symptoms on peanut leaves (Arachis hypogaea var. Landak) were used in this study. Fourteen point mutations on the coat protein gene have been identified among the PStV strains, however, only two point mutations at three positions (9309 of PStV-lsb and PStV-lbs and 9885 of PStV-lbs) resulted in amino acid residue changed of the coat protein. Pair comparison among six 3' UTR sequences of the strains revealed a 97.9-100 percent sequence similarity. The results provided evidence that all the strains were of the same virus and there is no correlation between typical symptoms of the PStV infection and CP sequence variability among the strains

индонезийский. Variabilitas beberapa strain peanut stripe virus (PStV) pada tingkat molekul diamati berdasarkan runutan nukleotida sistron penyandi protein selubung (CP) dan 3' UTR (Untranslated region) genom PStV. Penelitian ini menggunakan enam strain PStV yang masing-masing menimbulkan tipe gejala yang berbeda pada kacang tanah varietas Landak. Hasil penelitian ini menunjukkan adanya 14 lokasi mutasi titik pada sistron CP dari strain-strain PStV, namun demikian hanya dua lokasi saja yang berakibat pada perubahan residu asam amino CP. Mutasi titik yang menyebabkan terjadinya perbedaan asam amino tersebut ada pada posisi 9309 untuk PStV-lsb dan PStV-Ibs serta ke 9885 untuk PStV-Ibs. Hasil analisis runutan nukleotida 3' UTR menunjukkan bahwa strain-strain virus tersebut mempunyai kesamaan antara 97,9 persen sampai 100 persen; hal ini membuktikan bahwa strain-strain tersebut merupakan virus yang sama. Hasil penelitian ini juga menunjukkan perbedaan tipe gejala akibat infeksi masing-masing strain PStV pada kacang tanah tidak berkorelasi dengan variabilitas runutan nukleotida sistron CP