A Monte Carlo approach for estimation of haplotype probabilities [dairy cattle]
2003
Stella, A. (Fondazione Parco Tecnologico Padano, Lodi (Italy)) | Boettcher, P. (Consiglio Nazionale delle Ricerche, Milan (Italy). Istituto di Biologia e Biotecnologia Agraria) | Bolla, P. (Milan Univ. (Italy). Dipartimento di Scienze e Tecnologie Veterinarie per la Sicurezza Alimentare) | Pagnacco, G. (Milan Univ. (Italy). Dipartimento di Scienze e Tecnologie Veterinarie per la Sicurezza Alimentare)
Английский. [The objective of this study was the estimate of haplotype combination probabilities for members of half-sib families, given that genotypes were known for all siblings, but unknown for all parents. A Monte Carlo method based algorithm was developed and estimated. The software program utilizes half-sib genotypes to calculate the probability of every possible haplotype combination for a parent; this information is utilized to reconstruct half-sib haplotypes. So it is possible to estimate the effect of haplotypes by phenotype regression on haplotype probabilities.]
Показать больше [+] Меньше [-]итальянский. L´obiettivo di questo studio era di stimare le probabilità delle combinazioni di aplotipi per famiglie di mezzi fratelli, con genotipi noti per tutta la progenie e sconosciuti per i genitori. Un algoritmo, basato sul metodo Monte Carlo, è stato implementato e testato. Il software utilizza i genotipi dei mezzi fratelli per determinare la probabilità di ogni possibile combinazione di aplotipi per un genitore e usa questa informazione per ricostruire gli aplotipi dei mezzi fratelli. E´ quindi possibile stimare l´effetto degli aplotipi mediante regressione dei fenotipi sulle probabilità degli aplotipi
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