On farm conservation of common bean landraces: biochemical and molecular aspects [Phaseolus vulgaris L.; Basilicata; Lazio; Piedmont; Veneto]
2006
Lioi, L. | Piergiovanni, A.R. | Pignone, D. | Puglisi, S. | Santantonio, M. | Sonnante, G.
Английский. The present study was undertaken to estimate the level of variation among and within thirty-one local populations belonging to six common bean landraces, by analysing the polymorphism of SSR and AFLP molecular markers. The nutritional seed quality of the studied landraces was also investigated. Cluster analyses based on Nei's genetic distances and Jaccard's similarity index as defined by SSR and AFLP markers, respectively, showed that all populations clustered into two groups corresponding to the Andean and the Mesoamerican gene pools. The diversity analysis revealed contrasting levels of variability depending on the landrace. The highest level of variation was evidenced for the white small-seeded landrace Fagiolo del Purgatorio, whose populations were grouped in more than one subcluster. Knowledge of the genetic structure of a landrace is fundamental to elaborate strategies that, involving the local farmers, allow to improve and, at the same time, safeguard the genetic integrity of landrace genetic resources
Показать больше [+] Меньше [-]итальянский. E' stato valutato il livello di variabilità presente in 31 popolazioni locali di fagiolo appartenenti a sei varietà indigene analizzando il polimorfismo dei marcatori molecolari SSR e AFLP. E' stata pure studiata la qualità nutrizionale dei semi. Le analisi cluster, basate sia sulle distanze genetiche di Nei, sia sull'indice di somiglianza di Jaccard, definite rispettivamente dai marcatori SSR e AFLP, hanno mostrato che tutte le popolazioni si raggruppano in due grandi gruppi corrispondenti ai pool genici Andino e Mesoamericano. L'analisi della diversità ha evidenziato livelli contrastanti di variabilità secondo la varietà. Il più alto livello di diversità genetica e la sua più articolata strutturazione sono presenti nella cultivar a semi piccoli Fagiolo del Purgatorio, le cui popolazioni erano inserite in più di un sottoinsieme. La conoscenza della struttura genetica di una varietà indigena è fondamentale per elaborare strategie che, coinvolgendo gli agricoltori locali, consentono di migliorare e, allo stesso tempo, di salvaguardare l'integrità genetica delle risorse di germoplasma locale
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