About Samples in the Research of Intraspecific Genetic Diversity of Scots Pine (Pinus sylvestris L.) | О выборках в исследованиях внутривидового генетического разнообразия сосны обыкновенной

Английский. The influence of sample size on the results of the assessments of the genetic diversity of populations of Scots pine of 12 polymorphic loci allozymes and 4 chloroplast microsatellite loci (cpSSR) was investigated. According to the obtained results, the use of different genetic markers gives similar estimates of the proportion of species intrapopulation diversity. The contribution of individual variation within populations (Fst) was 98.5 % for the allozyme data and 97.9 % on cpSSR DNA markers. It was found that samples of more than 100 trees are characterized by a higher diversity of alleles. Shown was a logarithmic relationship between the number of identified chloroplast haplotypes and the volume and the number of samples in the studying area (correlation coefficient r = 0.983). An increase of up to 100 and more sample trees leads to reduction of genetic interpopulation distance Nei without significant change in the parameters characterizing the genetic structure of the species. Standard sample sizes (30-50 individuals) allow reliable estimates of the population genetic structure of the species, but not enough to study its intra-population diversity. Analysis of intrapopulation DNA genetic variation in few model populations of 300-500 trees would be useful for determining how diversity of haplotypes identified in populations depends on number of samples (therefore, on area of areal' part) and in what extent – on sample size.

Русский. Исследовано влияние величины выборки на результаты оценок генетического разнообразия популяций сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) по результатам анализа изменчивости 12 полиморфных локусов изоферментов и 4 микросателлитных локусов (cpSSR) хлоропластной ДНК. Согласно полученным результатам, использование разных генетических маркеров дает близкие оценки доли популяционного разнообразия вида. Доля индивидуальной изменчивости в пределах популяций (Fst) составляет 98.5% по данным аллозимного анализа и 97.9% по cpSSR. Установлено, что выборки численностью более 100 деревьев характеризуются более высоким разнообразием аллелей. Отмечена логарифмическая зависимость между числом выявленных хлоропластных гаплотипов и объемом и числом выборок на исследуемых территориях (коэффициент корреляции r = 0.983). Увеличение объема выборок до 100 и более деревьев ведет к сокращению генетических дистанций Неи между популяциями без существенного изменения параметров, характеризующих генетическую структуру вида. Стандартные объемы выборок (30-50 особей) позволяют адекватно оценить популяционную генетическую структуру вида, но недостаточны для изучения его внутрипопуляционного разнообразия. Анализ внутрипопуляционной генетической изменчивости ДНК в нескольких модельных популяциях на выборках 300–500 деревьев помог бы установить, насколько разнообразие выявленных в популяциях гаплотипов зависит от числа выборок (следовательно, от площади части ареала) и в какой степени – от их объема.