Инбридинг и степень гомозиготности микросателлитных локусов у лошадей (Equuscaballus) орловской рысистой породы | Inbreeding and homozygosity in Orlov trotter breed

Английский. Previously, it was showed that homozygosity degree (HD) on microsatellite loci (ML) in Thoroughbred horse is not based directly on inbreeding degree (ID). Further it was investigated ID effects in Orlov Trotter breed on individual level. Analysis was carried out of relationship between 16 ML HD (AHT4, AHT5, ASB2, ASB17, ASB23, CA425, HMS1, HMS2, HMS3, HMS6, HMS7, HTG4, HTG6, HTG7, HTG10, VHL20) and inbreeding indicator in 1194 individuals from 14 leading horse-breeding studs and farms in Russia, including 19 stallions, 688 mares and 316 foals. Data on LEX3 loci, localized in X-chromosome, were not taken into account to obtain comparable results on homo-/heterozygosity degree in different sex horses. It has been determined that HD in Orlov Trotters varies within wide range (from 0 up to 75.00%) and has normal distribution with positive asymmetry coefficient As=0.186 and small negative excess Ex=-0.039. Most wide variability on HD was indicated in mild inbreeding horses (Fx=0.1-1.0%). HD in outbred horses also varied significantly, from 0 (100% heterozygosity) to 56.30. Previously, similar trend in Thoroughbred horses was shown. Average tested horses ID amounted to 1.61% by Wright`s inbreeding coefficient (Fx) in 5 generations in pedigrees and in fact remained unchanged over past 4 decades. Average inbreeding coefficient in sires and mares reached 1.65% and 1.67%, respectively, while in young stock was 1.45% only. Changes dynamics in HD with increase of ID in all sex and age compared horses groups had unidirectional trend of slowly increasing. Significant HD rise was noted only at inbreeding coefficient of 6.10% and more, on inbred depression margin for economically valuable traits. The coefficient of correlation between the HD of ML and the ID was 0.079 with the regression coefficient of 0.546. In all groups, it has been found an evident decline in the HD in Orlov Trotter horses when the inbreeding coefficient reached 5.1-6.0% due to complex inbreeding.

Русский. Ранее было показано, что у чистокровной верховой породы степень гомозиготности (СГ) по микросателлитным локусам (МЛ) не имеет прямой зависимости от степени инбридинга (СИ) в родословной. Далее было изучено влияние СИ на индивидуальном уровне у лошадей орловской рысистой породы. Проведен анализ взаимосвязи между СГ по 16 МЛ (AHT4, AHT5, ASB2, ASB17, ASB23, CA425, HMS1, HMS2, HMS3, HMS6, HMS7, HTG4, HTG6, HTG7, HTG10, VHL20) и показателем инбридинга у 1194 особей из 14 хозяйств (ведущие конные заводы и племенные фермы) большинства регионов России (жеребцы-производители — 190 гол., матки — 688 гол., молодняк — 316 гол.). Данные по локусу LEX3, локализованному в Х-хромосоме, не учитывали, чтобы получить сопоставимые результаты по степени гомо-/гетерозиготности у лошадей разного пола. Было определено, что СГ орловских рысаков варьирует в широком интервале (от 0 до 75,0%) и имеет нормальное распределение при положительном коэффициенте асимметрии As=0,186 и не большом отрицательном эксцессе Ex=-0,039. Наибольший разброс показателей СГ зарегистрировали в группе лошадей с умеренным инбридингом (Fx=0,1-1,0%). СГ аутбредных лошадей также варьировала широко – от 0 до 56,3%. Ранее такая же закономерность была отмечена у лошадей чистокровной верховой породы. В среднем коэффициент инбридинга у протестированного поголовья составил 1,61% по Райту и практически не изменился за последние 40 лет. У продуцирующих жеребцов и маток он составил, соответственно, 1,65 и 1,67%, у рысистого молодняка — 1,45%. По мере увеличения коэффициента инбридинга СГ медленно возрастала во всех половозрастных группах лошадей. Заметное повышение СГ было выявлено только при СИ 6,10% и более (на границе инбредной депрессии по хозяйственно полезным признакам). Коэффициент корреляции между СГ МЛ и СИ составил 0,079, коэффициент регрессии — 0,546. Во всех исследованных группах орловских рысаков отмечалось снижение СГ при СИ 5,1-6,0%, что обусловлено применением комплексного инбридинга.