Characteristics of Influenza A virus isolates taken from swine in European Russia in 2013-2014 | Характеристика изолятов вируса гриппа А, выделенных от свиней в Европейской части России в 2013 – 2014 годах

Английский. There has been studied the influenza A virus circulation in hog-raising farms in the Leningrad, Pskov and Orenburg regions. The study was performed in 2013 – 2014. Nasal swabs were taken from 396 pigs aged 8 – 9 months. The following methods were used: molecular genetics (polymerase chain reaction, sequencing, phylogenetic analysis), isolation of influenza viruses in cell culture and chicken embryos, serological studies (hemagglutination inhibition test). The PCR permitted to identify and subtype influenza A virus in 41 swabs. This PCR-positive materials were used for isolation of influenza viruses and 8 viruses were isolated: 3 strains of A(H1N1)pdm09 subtype and 5 strains of А(H3N2) subtype. Antigenic analysis of these strains using hemagglutination inhibition test showed that all of them were antigenically similar to human influenza viruses that circulated in 2009 – 2010. The serology data were confirmed by sequencing and phylogenetic analysis of hemagglutinin and neuraminidase genes. Besides, 180 sera from swine were tested to analyze the presence of antibodies to influenza a viruses of А(H1N1), А(H1N1)pdm09, А(H2N2), А(H3N2), А(H5N1), А(H7N1), А(H9N2) subtypes. The antibodies to А(H1N1)pdm09 were detected in 7 sera, to А(H3N2) – in 1 serum. All other samples were seronegative for influenza A viruses. All isolated influenza viruses were deposited in a freeze-dried form to a collection of influenza viruses supported by the Research Institute of Influenza.

Русский. Изучена циркуляция вирусов гриппа А в свиноводческих хозяйствах Ленинградской, Псковской и Оренбургской областей. Обследование проводили в 2013 – 2014 гг. Назофарингеальные мазки были взяты у 396 свиней 8–9-месячного возраста. Использовали следующие методы исследования: молекулярно-генетические (полимеразная цепная реакция, секвенирование, филогенетический анализ), выделение вирусов гриппа на клеточной культуре и в куриных эмбрионах, серологические методы (реакция торможения гемагглютинирующей активности). В ходе проведения ПЦР удалось обнаружить вирус гриппа и определить его подтип в 41 образце, из которых впоследствии было выделено 8 вирусов гриппа типа А: 3 штамма подтипа A(H1N1)pdm09 и 5 штаммов подтипа A(H3N2). Антигенный анализ вирусов в реакции торможения гемагглютинирующей активности с крысиными антисыворотками показал, что все выделенные вирусы антигенно схожи с вирусами гриппа человека, циркулировавшими в 2009 – 2010 гг. Серологические данные были подтверждены филогенетическим анализом по генам гемагглютинина и нейраминидазы. Исследовали также 180 образцов сывороток крови от свиней на присутствие антител к вирусам гриппа подтипов А(H1N1), А(H1N1)pdm09, А(H2N2), А(H3N2), А(H5N1), А(H7N1), А(H9N2). Антитела к вирусам гриппа подтипа A(H1N1)pdm09 обнаружили в 7 образцах сывороток, в 1 образце найдены антитела к вирусу гриппа A(H3N2). Остальные образцы сывороток крови оказались серонегативными в отношении исследованных возбудителей. Все выделенные вирусы гриппа в лиофилизированном виде депонированы в коллекцию вирусов гриппа, которую поддерживает НИИ гриппа.