La viriosphère : quelle place dans le fonctionnement et l’évolution des écosystèmes aquatiques (partie 2)
2009
Berdjeb, Lyria | Jacquet, Stéphan
Au-delà de l’effet létal des virus sur les communautés microbiennes (typiquement les bactéries et le phytoplancton), l’activité virale peut affecter la structure de ces communautés ainsi que le cycle du carbone et des autres nutriments au sein des écosystèmes aquatiques. Par leur activité, les virus assureraient le maintien de la diversité au sein de communautés procaryotes en lysant les groupes les plus compétitifs et en permettant ainsi le développement des groupes minoritaires. Les virus constitueraient aussi le vecteur majeur dans le transfert horizontal des gènes entre espèces ou genres bactériens, et ils pourraient donc être un acteur essentiel remodelant la diversité microbienne à venir. La lyse virale qui induit la transformation de la biomasse en pool de matière organique dissoute stimulerait la respiration microbienne et réduirait le transfert du carbone vers les niveaux trophiques supérieurs ainsi que la sédimentation des particules vers le fond. Les connaissances apportées par l’étude de des virus dans les écosystèmes aquatiques ont enfin suscité un intérêt pour des applications environnementales, tel que le développement de la thérapie phagique dans les systèmes aquacoles. Cependant, un effort de recherche important reste à faire dans la compréhension de l’efficacité réelle de cette thérapie et des possibles phénomènes de résistance sous-jacents qu’elle peut engendrer.
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