Caracterização funcional do transcriptoma de amendoim forrageiro.
2023
OLIVEIRA, J. C. de | FORMIGHIERI, E. F. | GARCIA, A. L. B. | MARGARIDO, G. R. A. | CAMPOS, T. de | JÔNATAS CHAGAS DE OLIVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ACRE; EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; ANA LETYCIA BASSO GARCIA, ESCOLA SUPERIOR DE AGRICULTURA LUIZ DE QUEIROZ; GABRIEL RODRIGUES ALVES MARGARIDO, ESCOLA SUPERIOR DE AGRICULTURA LUIZ DE QUEIROZ; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC.
O uso do amendoim forrageiro em consórcios com gramíneas nas pastagens e como cobertura verde, consorciado com culturas comerciais, tem crescido nos últimos anos. A análise do genoma funcional permite a identificação de genes de interesse agronômico. Assim, o objetivo deste trabalho foi realizar a anotação funcional de genes do transcriptoma de folhas de Arachis pintoi. Dos 98.432 transcritos analisados, 69% apresentaram correspondências com o banco de dados de proteínas do National Center of Biotechnology Information. As classes função molecular (36%) e processo biológico (35,8%) representaram a maioria dos termos de Gene Ontology atribuídos, enquanto o componente celular (28,2%) apresentou menor número. A análise de expressão diferencial identificou 1.550 e 1.357 genes com maior nível de expressão nas cultivares Amarillo e Belomonte, respectivamente. A análise de enriquecimento dos genes mostrou que 55,63% pertencem à classe componente celular, seguida por função molecular (26,48%) e processo biológico (20,89%). Esses resultados são o primeiro relato de anotação funcional de A. pintoi que irá fornecer uma importante fonte de informação para avanços nos estudos de expressão, silenciamento e edição gênica nos programas de melhoramento de Arachis.
Показать больше [+] Меньше [-]Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau.
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Библиографическая информация
Эту запись предоставил Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária