Genome-wide analysis associations for fatty acids composition in cow's milk of red Gorbatov breed | Полногеномный анализ ассоциаций с жирнокислотным составом молока коров красной горбатовской породы

Английский. The spectrum of fatty acids (FA) in 245 milk samples from gene pool Red Gorbatov cows was studied. In the structure of the components of fatty acid composition in milk saturated FAs dominated - up to 62% (C16:0 - 0.794 g/100 g of milk). A high content of oleic acid (C18:1) of 1.126 g/100 g of milk was found in the group of monounsaturated fatty acids. Depending on the carbon chain length in the spring-summer period medium- and long-chain fatty acids of 1.165 and 1.433 g/100 g of milk, respectively, predominate in milk. The proportion of FA trans-isomers in milk was almost 2% (Cv is 90%), whereas FA contents have a positive correlation of above 0.7 against each other. Common clusters were found on BTA 9 and 22 for palmitic and myristic FAs; on BTA 20 for palmitic, myristic and oleic FAs; on BTA 25 for palmitic, myristic, stearic and oleic FAs. Common associations independent on the FA chain length and localized on the BTA 25 chromosome were found. The group of saturated, unsaturated FA and trans-isomers shows common QTL on BTA 8 (except for NFA, PUFA), 18 (except for MNFA), 20 (except for PUFA) and 25. The genes forming QTL on chromosomes BTA 1, 3, 17, 22, 25, 29: ERG, LRRC8D, RAPGEF2, TEX264, AUTS2, LIMK1, STT3A, ACRV1have been established for the myristic FA; for short-chain FA on chromosomes BTA 1, 13: PCOLCE2, ATRN; for medium-chain FA on BTA 25: HS3ST2; for trans-isomers - on chromosomes BTA 11, 20, 24:POLE4, C1QTNF3, CTNND2, DSG2. For all FA types and trans-isomers, the QTL region on the BTA 25 chromosome - LIMK1 and AUTS2 - is determined. These genes have a pleiotropic effect on some FA traits and are of interest for further study. The annotation of genes showed their conjugation with the traits of milk protein (LRRC8D), milk yield and milking rate (LRRC8D, CTNND2), eye area pigmentation (ATRN), somatic cells count (C1QTNF3), susceptibility to tuberculosis, content of pentadecylic acid in milk and level of thyroxine (CTNND2), as well as the amount of calcium in milk (HS3ST2).

Русский. Исследован спектр жирных кислот (ЖК) 245 образцов молока коров генофондной красной горбатовской породы. В структуре компонентов жирнокислотного состава молока преобладали насыщенные ЖК - до 62% (С16:0 - 0,794 г/100 г молока). В группе мононенасыщенных ЖК обнаружено высокое содержание олеиновой (С18:1) ЖК - 1,126 г/100 г молока. В зависимости от длины углеродной цепи в весенне-летний период в молоке преобладают средне- и длинноцепочечные ЖК - 1,165 и 1,433 г/100 г молока соответственно. Доля трансизомеров ЖК в молоке составила почти 2% (Сv - 90%). Между собой ЖК имеют положительную корреляцию более 0,7. Выявлены общие кластеры на BTA 9 и 22 - для пальмитиновой и миристиновой ЖК; на BTA 20 - для пальмитиновой, миристиновой и олеиновой ЖК; на BTA 25 - для пальмитиновой, миристиновой, стеариновой и олеиновой ЖК. Обнаружены общие ассоциации, не зависящие от длины цепи ЖК и локализованные на хромосоме BTA 25. Группа насыщенных, ненасыщенных ЖК и трансизомеров показывает общие QTL на BTA 8 (кроме НЖК, ПНЖК), 18 (кроме МНЖК), 20 (кроме ПНЖК) и 25. Для показателей миристиновой ЖК установлены гены, образующие QTL на хромосомах BTA 1, 3, 17, 22, 25, 29: ERG, LRRC8D, RAPGEF2, TEX264, AUTS2, LIMK1, STT3A, ACRV1; для короткоцепочечных ЖК - на хромосомах BTA 1, 13: PCOLCE2, ATRN; для среднецепочечных ЖК - на BTA 25: HS3ST2; для трансизомеров - на хромосомах BTA 11, 20, 24: POLE4, C1QTNF3, CTNND2, DSG2. Для всех типов ЖК и трансизомеров определен участок QTL на хромосоме BTA 25 - LIMK1 и AUTS2. Эти гены оказывают плейотропное действие на целый ряд показателей ЖК и представляют интерес для дальнейшего изучения. Аннотация генов показала сопряженность их с признаками молочного белка (LRRC8D), удоя и скорости доения (LRRC8D, CTNND2), с пигментацией области глаз (ATRN), количеством соматических клеток в молоке (C1QTNF3), восприимчивостью к туберкулезу, содержанием пентадециловой кислоты в молоке и уровнем тироксина (CTNND2), а также с количеством кальция в молоке (HS3ST2).